User Tools

Site Tools


typing:molecular_typing

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revisionPrevious revision
Next revision
Previous revision
typing:molecular_typing [2025/07/21 14:02] – [References] rkoebniktyping:molecular_typing [2025/07/28 09:38] (current) – [References] rkoebnik
Line 27: Line 27:
 | //Xylella fastidiosa//                                          | [[https://doi.org/10.1128/AEM.67.9.4091-4095.2001|Coletta-Filho (2001)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.68.8.3731-3736.2002|Coletta-Filho (2002)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO.2003.93.1.28|Coletta-Filho (2003)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-97-10-1338|Montero-Astúa (2007)]]  | [[https://doi.org/10.1128/AEM.67.9.4091-4095.2001|Coletta-Filho (2001)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.68.8.3731-3736.2002|Coletta-Filho (2002)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO.2003.93.1.28|Coletta-Filho (2003)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-97-10-1338|Montero-Astúa (2007)]], \\  [[https://doi.org/10.1038/s41598-020-68072-5|Mazzaglia (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.1038/s42003-023-04499-6|Dupas (2023)]]                                                                                      |  NA                                                                                                                                                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1128/AEM.71.12.8491-8499.2005|Scally (2005)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.02388-07|Almeida (2008)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-100-6-0601|Yuan (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.06679-11|Parker (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.01126-12|Nunney (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03208-12|Nunney (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.02920-13|Nunney (2014a)]], \\  [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0112463|Nunney (2014b)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03299-15|Jacques (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1007/s00203-016-1245-1|Marcelletti (2016)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-09-16-0321-R|Coletta-Filho (2017)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.01521-19|Landa (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-09-20-1900-RE|Aguilar-Granados (2021)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/aem.02356-21|Kahn (2022)]]  | | //Xylella fastidiosa//                                          | [[https://doi.org/10.1128/AEM.67.9.4091-4095.2001|Coletta-Filho (2001)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.68.8.3731-3736.2002|Coletta-Filho (2002)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO.2003.93.1.28|Coletta-Filho (2003)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-97-10-1338|Montero-Astúa (2007)]]  | [[https://doi.org/10.1128/AEM.67.9.4091-4095.2001|Coletta-Filho (2001)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.68.8.3731-3736.2002|Coletta-Filho (2002)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO.2003.93.1.28|Coletta-Filho (2003)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-97-10-1338|Montero-Astúa (2007)]], \\  [[https://doi.org/10.1038/s41598-020-68072-5|Mazzaglia (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.1038/s42003-023-04499-6|Dupas (2023)]]                                                                                      |  NA                                                                                                                                                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1128/AEM.71.12.8491-8499.2005|Scally (2005)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.02388-07|Almeida (2008)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-100-6-0601|Yuan (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.06679-11|Parker (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.01126-12|Nunney (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03208-12|Nunney (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.02920-13|Nunney (2014a)]], \\  [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0112463|Nunney (2014b)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03299-15|Jacques (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1007/s00203-016-1245-1|Marcelletti (2016)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-09-16-0321-R|Coletta-Filho (2017)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.01521-19|Landa (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-09-20-1900-RE|Aguilar-Granados (2021)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/aem.02356-21|Kahn (2022)]]  |
 | **Other**                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ||||| | **Other**                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     |||||
-| //X. phaseoli// pv. //manihotis//                                NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                     | [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0079704|Arrieta-Ortiz (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.1186/1471-2180-14-161|Trujillo (2014)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-06-18-0210-R|Rache (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0285491|Rache (2023)]]                                                                                                                                                                                                                                                       |  NA                                                                                                                                                                                                                                                            NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               |+| //X. phaseoli// pv. //manihotis//                                NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                     | [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0079704|Arrieta-Ortiz (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.1186/1471-2180-14-161|Trujillo (2014)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-06-18-0210-R|Rache (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2023.v58.03299|De Oliveira (2023)]], \\  [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0285491|Rache (2023)]]                                                                                                                                                                      |  NA                                                                                                                                                                                                                                                            NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               |
  
 <sup>1</sup>  NA: not available. <sup>1</sup>  NA: not available.
Line 130: Line 130:
 Montero-Astúa M, Hartung JS, Aguilar E, Chacón C, Li W, Albertazzi FJ, Rivera C (2007). Genetic diversity of //Xylella fastidiosa// strains from Costa Rica, São Paulo, Brazil, and United States. Phytopathology 97: 1338-1347. DOI: [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-97-10-1338|10.1094/PHYTO-97-10-1338]] Montero-Astúa M, Hartung JS, Aguilar E, Chacón C, Li W, Albertazzi FJ, Rivera C (2007). Genetic diversity of //Xylella fastidiosa// strains from Costa Rica, São Paulo, Brazil, and United States. Phytopathology 97: 1338-1347. DOI: [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-97-10-1338|10.1094/PHYTO-97-10-1338]]
  
-Nunney L, Hopkins DL, Morano LD, Russell SE, Stouthamer R (2014a). Intersubspecific recombination in //Xylella fastidiosa// Strains native to the United States: infection of novel hosts associated with an unsuccessful invasion. Appl. Environ. Microbiol. 80: 1159-1169. DOI: [[https://doi.org/10.1128/AEM.02920-13|10.1128/AEM.02920-13]]+Nunney L, Hopkins DL, Morano LD, Russell SE, Stouthamer R (2014a). Intersubspecific recombination in //Xylella fastidiosa// strains native to the United States: infection of novel hosts associated with an unsuccessful invasion. Appl. Environ. Microbiol. 80: 1159-1169. DOI: [[https://doi.org/10.1128/AEM.02920-13|10.1128/AEM.02920-13]]
  
-Nunney L, Ortiz B, Russell SA, Ruiz Sánchez R, Stouthamer R (2014b). The complex biogeography of the plant pathogen //Xylella fastidiosa//: genetic evidence of introductions and Subspecific introgression in Central America. PLoS One 9: e112463. DOI: [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0112463|10.1371/journal.pone.0112463]]+Nunney L, Ortiz B, Russell SA, Ruiz Sánchez R, Stouthamer R (2014b). The complex biogeography of the plant pathogen //Xylella fastidiosa//: genetic evidence of introductions and subspecific introgression in Central America. PLoS One 9: e112463. DOI: [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0112463|10.1371/journal.pone.0112463]]
  
 Nunney L, Vickerman DB, Bromley RE, Russell SA, Hartman JR, Morano LD, Stouthamer R (2013). Recent evolutionary radiation and host plant specialization in the //Xylella fastidiosa// subspecies native to the United States. Appl. Environ. Microbiol. 79: 2189-2200. DOI: [[https://doi.org/10.1128/AEM.03208-12|10.1128/AEM.03208-12]] Nunney L, Vickerman DB, Bromley RE, Russell SA, Hartman JR, Morano LD, Stouthamer R (2013). Recent evolutionary radiation and host plant specialization in the //Xylella fastidiosa// subspecies native to the United States. Appl. Environ. Microbiol. 79: 2189-2200. DOI: [[https://doi.org/10.1128/AEM.03208-12|10.1128/AEM.03208-12]]
typing/molecular_typing.1753102935.txt.gz · Last modified: 2025/07/21 14:02 by rkoebnik