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 | //Xylella fastidiosa//                                          | [[https://doi.org/10.1128/AEM.67.9.4091-4095.2001|Coletta-Filho (2001)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.68.8.3731-3736.2002|Coletta-Filho (2002)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO.2003.93.1.28|Coletta-Filho (2003)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-97-10-1338|Montero-Astúa (2007)]]  | [[https://doi.org/10.1128/AEM.67.9.4091-4095.2001|Coletta-Filho (2001)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.68.8.3731-3736.2002|Coletta-Filho (2002)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO.2003.93.1.28|Coletta-Filho (2003)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-97-10-1338|Montero-Astúa (2007)]], \\  [[https://doi.org/10.1038/s41598-020-68072-5|Mazzaglia (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.1038/s42003-023-04499-6|Dupas (2023)]]                                                                                      |  NA                                                                                                                                                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1128/AEM.71.12.8491-8499.2005|Scally (2005)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.02388-07|Almeida (2008)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-100-6-0601|Yuan (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.06679-11|Parker (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.01126-12|Nunney (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03208-12|Nunney (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.02920-13|Nunney (2014a)]], \\  [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0112463|Nunney (2014b)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03299-15|Jacques (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1007/s00203-016-1245-1|Marcelletti (2016)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-09-16-0321-R|Coletta-Filho (2017)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.01521-19|Landa (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-09-20-1900-RE|Aguilar-Granados (2021)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/aem.02356-21|Kahn (2022)]]  | | //Xylella fastidiosa//                                          | [[https://doi.org/10.1128/AEM.67.9.4091-4095.2001|Coletta-Filho (2001)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.68.8.3731-3736.2002|Coletta-Filho (2002)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO.2003.93.1.28|Coletta-Filho (2003)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-97-10-1338|Montero-Astúa (2007)]]  | [[https://doi.org/10.1128/AEM.67.9.4091-4095.2001|Coletta-Filho (2001)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.68.8.3731-3736.2002|Coletta-Filho (2002)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO.2003.93.1.28|Coletta-Filho (2003)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-97-10-1338|Montero-Astúa (2007)]], \\  [[https://doi.org/10.1038/s41598-020-68072-5|Mazzaglia (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.1038/s42003-023-04499-6|Dupas (2023)]]                                                                                      |  NA                                                                                                                                                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1128/AEM.71.12.8491-8499.2005|Scally (2005)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.02388-07|Almeida (2008)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-100-6-0601|Yuan (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.06679-11|Parker (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.01126-12|Nunney (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03208-12|Nunney (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.02920-13|Nunney (2014a)]], \\  [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0112463|Nunney (2014b)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03299-15|Jacques (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1007/s00203-016-1245-1|Marcelletti (2016)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-09-16-0321-R|Coletta-Filho (2017)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.01521-19|Landa (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-09-20-1900-RE|Aguilar-Granados (2021)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/aem.02356-21|Kahn (2022)]]  |
 | **Other**                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ||||| | **Other**                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     |||||
-| //X. phaseoli// pv. //manihotis//                                NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                     |  NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               |  NA                                                                                                                                                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0058474|Mhedbi-Hajri (2013)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              |+| //X. phaseoli// pv. //manihotis//                                NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                     [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0079704|Arrieta-Ortiz (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.1186/1471-2180-14-161|Trujillo (2014)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-06-18-0210-R|Rache (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0285491|Rache (2023)]]                                                                                                                                                                                                                                                       |  NA                                                                                                                                                                                                                                                            NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               |
  
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 Almeida RP, Nascimento FE, Chau J, Prado SS, Tsai CW, Lopes SA, Lopes JR (2008). Genetic structure and biology of //Xylella fastidiosa// strains causing disease in citrus and coffee in Brazil. Appl. Environ. Microbiol. 74: 3690-3701. DOI: [[https://doi.org/10.1128/AEM.02388-07|10.1128/AEM.02388-07]] Almeida RP, Nascimento FE, Chau J, Prado SS, Tsai CW, Lopes SA, Lopes JR (2008). Genetic structure and biology of //Xylella fastidiosa// strains causing disease in citrus and coffee in Brazil. Appl. Environ. Microbiol. 74: 3690-3701. DOI: [[https://doi.org/10.1128/AEM.02388-07|10.1128/AEM.02388-07]]
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 +Arrieta-Ortiz ML, Rodríguez-R LM, Pérez-Quintero Á, Poulin L, Díaz AC, Arias Rojas N, Trujillo C, Restrepo Benavides M, Bart R, Boch J, Boureau T, Darrasse A, David P, Dugé de Bernonville T, Fontanilla P, Gagnevin L, Guérin F, Jacques MA, Lauber E, Lefeuvre P, Medina C, Medina E, Montenegro N, Muñoz Bodnar A, Noël LD, Ortiz Quiñones JF, Osorio D, Pardo C, Patil PB, Poussier S, Pruvost O, Robène-Soustrade I, Ryan RP, Tabima J, Urrego Morales OG, Vernière C, Carrere S, Verdier V, Szurek B, Restrepo S, López C, Koebnik R, Bernal A (2013). Genomic survey of pathogenicity determinants and VNTR markers in the cassava bacterial pathogen //Xanthomonas axonopodis// pv. //manihotis// strain CIO151. PLoS One 8: e79704. DOI: [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0079704|10.1371/journal.pone.0079704]]
  
 Bellanger N, Dereeper A, Koebnik R (2022). Clustered regularly interspaced short palindromic repeats in //Xanthomonas citri //- witnesses to a global expansion of a bacterial pathogen over time. Microorganisms 10: 1715. DOI: [[http://doi.org/10.3390/microorganisms10091715|10.3390/microorganisms10091715]] Bellanger N, Dereeper A, Koebnik R (2022). Clustered regularly interspaced short palindromic repeats in //Xanthomonas citri //- witnesses to a global expansion of a bacterial pathogen over time. Microorganisms 10: 1715. DOI: [[http://doi.org/10.3390/microorganisms10091715|10.3390/microorganisms10091715]]
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 Pruvost O, Richard D, Boyer K, Javegny S, Boyer C, Chiroleu F, Grygiel P, Parvedy E, Robène I, Maillot-Lebon V, Hamza A, Lobin KK, Naiken M, Vernière C (2021). Diversity and geographical structure of //Xanthomonas citri// pv. citri on Citrus in the South West Indian Ocean Region. Microorganisms 9: 945. DOI: [[https://doi.org/10.3390/microorganisms9050945|10.3390/microorganisms9050945]] Pruvost O, Richard D, Boyer K, Javegny S, Boyer C, Chiroleu F, Grygiel P, Parvedy E, Robène I, Maillot-Lebon V, Hamza A, Lobin KK, Naiken M, Vernière C (2021). Diversity and geographical structure of //Xanthomonas citri// pv. citri on Citrus in the South West Indian Ocean Region. Microorganisms 9: 945. DOI: [[https://doi.org/10.3390/microorganisms9050945|10.3390/microorganisms9050945]]
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 +Rache L, Blondin L, Diaz Tatis P, Flores C, Camargo A, Kante M, Wonni I, López C, Szurek B, Dupas S, Pruvost O, Koebnik R, Restrepo S, Bernal A, Vernière C (2023). A minisatellite-based MLVA for deciphering the global epidemiology of the bacterial cassava pathogen //Xanthomonas phaseoli// pv. //manihotis//. PLoS One 18: e0285491. DOI: [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0285491|10.1371/journal.pone.0285491]]
 +
 +Rache L, Blondin L, Flores C, Trujillo C, Szurek B, Restrepo S, Koebnik R, Bernal A, Vernière C (2019). An optimized microsatellite scheme for assessing populations of //Xanthomonas phaseoli// pv. //manihotis//. Phytopathology 109: 859-869. DOI: [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-06-18-0210-R|10.1094/PHYTO-06-18-0210-R]]
  
 Rademaker JL, Norman DJ, Forster RL, Louws FJ, Schultz MH, de Bruijn FJ (2006). Classification and identification of //Xanthomonas translucens// isolates, including those pathogenic to ornamental asparagus. Phytopathology 96: 876-884. DOI: [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-96-0876|10.1094/PHYTO-96-0876]] Rademaker JL, Norman DJ, Forster RL, Louws FJ, Schultz MH, de Bruijn FJ (2006). Classification and identification of //Xanthomonas translucens// isolates, including those pathogenic to ornamental asparagus. Phytopathology 96: 876-884. DOI: [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-96-0876|10.1094/PHYTO-96-0876]]
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 Timilsina S, Jibrin MO, Potnis N, Minsavage GV, Kebede M, Schwartz A, Bart R, Staskawicz B, Boyer C, Vallad GE, Pruvost O, Jones JB, Goss EM (2015). Multilocus sequence analysis of xanthomonads causing bacterial spot of tomato and pepper plants reveals strains generated by recombination among species and recent global spread of //Xanthomonas gardneri.// Appl. Environ. Microbiol. 81: 1520-1529. DOI: [[https://doi.org/10.1128/AEM.03000-14|10.1128/AEM.03000-14]] Timilsina S, Jibrin MO, Potnis N, Minsavage GV, Kebede M, Schwartz A, Bart R, Staskawicz B, Boyer C, Vallad GE, Pruvost O, Jones JB, Goss EM (2015). Multilocus sequence analysis of xanthomonads causing bacterial spot of tomato and pepper plants reveals strains generated by recombination among species and recent global spread of //Xanthomonas gardneri.// Appl. Environ. Microbiol. 81: 1520-1529. DOI: [[https://doi.org/10.1128/AEM.03000-14|10.1128/AEM.03000-14]]
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 +Trujillo CA, Arias-Rojas N, Poulin L, Medina CA, Tapiero A, Restrepo S, Koebnik R, Bernal AJ (2014). Population typing of the causal agent of cassava bacterial blight in the Eastern Plains of Colombia using two types of molecular markers. BMC Microbiol. 14: 161. DOI: [[https://doi.org/10.1186/1471-2180-14-161|10.1186/1471-2180-14-161]]
  
 Vancheva T, Bogatzevska N, Moncheva P, Mitrev S, Vernière C, Koebnik R (2021). Molecular epidemiology of //Xanthomonas euvesicatoria// strains from the Balkan Peninsula revealed by a new multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis scheme. Microorganisms 9: 536. DOI: [[https://doi.org/10.3390/microorganisms9030536|10.3390/microorganisms9030536]] Vancheva T, Bogatzevska N, Moncheva P, Mitrev S, Vernière C, Koebnik R (2021). Molecular epidemiology of //Xanthomonas euvesicatoria// strains from the Balkan Peninsula revealed by a new multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis scheme. Microorganisms 9: 536. DOI: [[https://doi.org/10.3390/microorganisms9030536|10.3390/microorganisms9030536]]
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