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 | //X. arboricola// pv. //pruni//                                 | [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-95-1081|Boudon (2005)]]                                                                                                                                                                                                                                                 | [[https://doi.org/10.1016/j.mimet.2014.02.017|Cesbron (2014)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.00835-15|Essakhi (2015)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        NA                                                                                                                                                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-95-1081|Boudon (2005)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.00835-15|Essakhi (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.00050-15|Fischer-Le Saux (2015)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         | | //X. arboricola// pv. //pruni//                                 | [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-95-1081|Boudon (2005)]]                                                                                                                                                                                                                                                 | [[https://doi.org/10.1016/j.mimet.2014.02.017|Cesbron (2014)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.00835-15|Essakhi (2015)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        NA                                                                                                                                                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-95-1081|Boudon (2005)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.00835-15|Essakhi (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.00050-15|Fischer-Le Saux (2015)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
 | //X. axonopodis// pv. //poinsettiicola//                        |  NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                      NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                NA                                                                                                                                                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-08-14-0867-RE|Rockey (2015)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      | | //X. axonopodis// pv. //poinsettiicola//                        |  NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                      NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                NA                                                                                                                                                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-08-14-0867-RE|Rockey (2015)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      |
-| //X. euvesicatoria// pv. //euvesicatoria//                      | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-94-8-0993|Hamza (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.syapm.2011.12.005|Hamza (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.bjm.2017.08.011|Vancheva (2018)]],  \\  [[https://doi.org/10.5423/PPJ.OA.09.2024.0138|Siddique (2025)]]                                      | [[https://doi.org/10.3390/microorganisms9030536|Vancheva (2021)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  NA                                                                                                                                                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-94-8-0993|Hamza (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.syapm.2011.12.005|Hamza (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0058474|Mhedbi-Hajri (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03000-14|Timilsina (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.3390/microorganisms710046227|Dhakal (2019)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         |+| //X. euvesicatoria// pv. //euvesicatoria//                      | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-94-8-0993|Hamza (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.syapm.2011.12.005|Hamza (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.bjm.2017.08.011|Vancheva (2018)]], \\  [[https://doi.org/10.5423/PPJ.OA.09.2024.0138|Siddique (2025)]]                                       | [[https://doi.org/10.3390/microorganisms9030536|Vancheva (2021)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  NA                                                                                                                                                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-94-8-0993|Hamza (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.syapm.2011.12.005|Hamza (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0058474|Mhedbi-Hajri (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03000-14|Timilsina (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.3390/microorganisms710046227|Dhakal (2019)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
 | //X. euvesicatoria// pv. //perforans//                          | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-94-8-0993|Hamza (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.syapm.2011.12.005|Hamza (2012)]]                                                                                                                                                                               | [[https://doi.org/10.3390/microorganisms9030536|Vancheva (2021)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  NA                                                                                                                                                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-94-8-0993|Hamza (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.syapm.2011.12.005|Hamza (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03000-14|Timilsina (2015)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          | | //X. euvesicatoria// pv. //perforans//                          | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-94-8-0993|Hamza (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.syapm.2011.12.005|Hamza (2012)]]                                                                                                                                                                               | [[https://doi.org/10.3390/microorganisms9030536|Vancheva (2021)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  NA                                                                                                                                                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-94-8-0993|Hamza (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.syapm.2011.12.005|Hamza (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03000-14|Timilsina (2015)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          |
 | //X. fragariae//                                                | [[https://doi.org/10.1128/aem.62.9.3121-3127.1996|Pooler (1996)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.64.10.3961-3965.1998|Roberts (1998)]]                                                                                                                                                              | [[https://doi.org/10.1099/mgen.0.000189/29874158/|Gétaz (2018)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  | [[https://doi.org/10.1099/mgen.0.000189/29874158/|Gétaz (2018)]]                                                                                                                                                                                              | [[https://doi.org/10.1099/mgen.0.000189/29874158/|Gétaz (2018)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-05-23-0933-SC|Wei (2023)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   | | //X. fragariae//                                                | [[https://doi.org/10.1128/aem.62.9.3121-3127.1996|Pooler (1996)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.64.10.3961-3965.1998|Roberts (1998)]]                                                                                                                                                              | [[https://doi.org/10.1099/mgen.0.000189/29874158/|Gétaz (2018)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  | [[https://doi.org/10.1099/mgen.0.000189/29874158/|Gétaz (2018)]]                                                                                                                                                                                              | [[https://doi.org/10.1099/mgen.0.000189/29874158/|Gétaz (2018)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-05-23-0933-SC|Wei (2023)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   |
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 | //X. vesicatoria//                                              | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-94-8-0993|Hamza (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.syapm.2011.12.005|Hamza (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.bjm.2017.08.011|Vancheva (2018)]]                                                                                                            |  NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                NA                                                                                                                                                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-94-8-0993|Hamza (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.syapm.2011.12.005|Hamza (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03000-14|Timilsina (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.3390/microorganisms710046227|Dhakal (2019)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   | | //X. vesicatoria//                                              | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-94-8-0993|Hamza (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.syapm.2011.12.005|Hamza (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.bjm.2017.08.011|Vancheva (2018)]]                                                                                                            |  NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                NA                                                                                                                                                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-94-8-0993|Hamza (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.syapm.2011.12.005|Hamza (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03000-14|Timilsina (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.3390/microorganisms710046227|Dhakal (2019)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   |
 | //Xylella fastidiosa//                                          | [[https://doi.org/10.1128/AEM.67.9.4091-4095.2001|Coletta-Filho (2001)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.68.8.3731-3736.2002|Coletta-Filho (2002)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO.2003.93.1.28|Coletta-Filho (2003)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-97-10-1338|Montero-Astúa (2007)]]  | [[https://doi.org/10.1128/AEM.67.9.4091-4095.2001|Coletta-Filho (2001)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.68.8.3731-3736.2002|Coletta-Filho (2002)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO.2003.93.1.28|Coletta-Filho (2003)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-97-10-1338|Montero-Astúa (2007)]], \\  [[https://doi.org/10.1038/s41598-020-68072-5|Mazzaglia (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.1038/s42003-023-04499-6|Dupas (2023)]]                                                                                      |  NA                                                                                                                                                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1128/AEM.71.12.8491-8499.2005|Scally (2005)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.02388-07|Almeida (2008)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-100-6-0601|Yuan (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.06679-11|Parker (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.01126-12|Nunney (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03208-12|Nunney (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.02920-13|Nunney (2014a)]], \\  [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0112463|Nunney (2014b)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03299-15|Jacques (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1007/s00203-016-1245-1|Marcelletti (2016)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-09-16-0321-R|Coletta-Filho (2017)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.01521-19|Landa (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-09-20-1900-RE|Aguilar-Granados (2021)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/aem.02356-21|Kahn (2022)]]  | | //Xylella fastidiosa//                                          | [[https://doi.org/10.1128/AEM.67.9.4091-4095.2001|Coletta-Filho (2001)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.68.8.3731-3736.2002|Coletta-Filho (2002)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO.2003.93.1.28|Coletta-Filho (2003)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-97-10-1338|Montero-Astúa (2007)]]  | [[https://doi.org/10.1128/AEM.67.9.4091-4095.2001|Coletta-Filho (2001)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.68.8.3731-3736.2002|Coletta-Filho (2002)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO.2003.93.1.28|Coletta-Filho (2003)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-97-10-1338|Montero-Astúa (2007)]], \\  [[https://doi.org/10.1038/s41598-020-68072-5|Mazzaglia (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.1038/s42003-023-04499-6|Dupas (2023)]]                                                                                      |  NA                                                                                                                                                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1128/AEM.71.12.8491-8499.2005|Scally (2005)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.02388-07|Almeida (2008)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-100-6-0601|Yuan (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.06679-11|Parker (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.01126-12|Nunney (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03208-12|Nunney (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.02920-13|Nunney (2014a)]], \\  [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0112463|Nunney (2014b)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.03299-15|Jacques (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1007/s00203-016-1245-1|Marcelletti (2016)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-09-16-0321-R|Coletta-Filho (2017)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.01521-19|Landa (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-09-20-1900-RE|Aguilar-Granados (2021)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/aem.02356-21|Kahn (2022)]]  |
 +| **Other**                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     |||||
 +| //X. phaseoli// pv. //manihotis//                                NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                     | [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0079704|Arrieta-Ortiz (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.1186/1471-2180-14-161|Trujillo (2014)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-06-18-0210-R|Rache (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0285491|Rache (2023)]]                                                                                                                                                                                                                                                        NA                                                                                                                                                                                                                                                            NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               |
  
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 Almeida RP, Nascimento FE, Chau J, Prado SS, Tsai CW, Lopes SA, Lopes JR (2008). Genetic structure and biology of //Xylella fastidiosa// strains causing disease in citrus and coffee in Brazil. Appl. Environ. Microbiol. 74: 3690-3701. DOI: [[https://doi.org/10.1128/AEM.02388-07|10.1128/AEM.02388-07]] Almeida RP, Nascimento FE, Chau J, Prado SS, Tsai CW, Lopes SA, Lopes JR (2008). Genetic structure and biology of //Xylella fastidiosa// strains causing disease in citrus and coffee in Brazil. Appl. Environ. Microbiol. 74: 3690-3701. DOI: [[https://doi.org/10.1128/AEM.02388-07|10.1128/AEM.02388-07]]
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 +Arrieta-Ortiz ML, Rodríguez-R LM, Pérez-Quintero Á, Poulin L, Díaz AC, Arias Rojas N, Trujillo C, Restrepo Benavides M, Bart R, Boch J, Boureau T, Darrasse A, David P, Dugé de Bernonville T, Fontanilla P, Gagnevin L, Guérin F, Jacques MA, Lauber E, Lefeuvre P, Medina C, Medina E, Montenegro N, Muñoz Bodnar A, Noël LD, Ortiz Quiñones JF, Osorio D, Pardo C, Patil PB, Poussier S, Pruvost O, Robène-Soustrade I, Ryan RP, Tabima J, Urrego Morales OG, Vernière C, Carrere S, Verdier V, Szurek B, Restrepo S, López C, Koebnik R, Bernal A (2013). Genomic survey of pathogenicity determinants and VNTR markers in the cassava bacterial pathogen //Xanthomonas axonopodis// pv. //manihotis// strain CIO151. PLoS One 8: e79704. DOI: [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0079704|10.1371/journal.pone.0079704]]
  
 Bellanger N, Dereeper A, Koebnik R (2022). Clustered regularly interspaced short palindromic repeats in //Xanthomonas citri //- witnesses to a global expansion of a bacterial pathogen over time. Microorganisms 10: 1715. DOI: [[http://doi.org/10.3390/microorganisms10091715|10.3390/microorganisms10091715]] Bellanger N, Dereeper A, Koebnik R (2022). Clustered regularly interspaced short palindromic repeats in //Xanthomonas citri //- witnesses to a global expansion of a bacterial pathogen over time. Microorganisms 10: 1715. DOI: [[http://doi.org/10.3390/microorganisms10091715|10.3390/microorganisms10091715]]
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 Pruvost O, Richard D, Boyer K, Javegny S, Boyer C, Chiroleu F, Grygiel P, Parvedy E, Robène I, Maillot-Lebon V, Hamza A, Lobin KK, Naiken M, Vernière C (2021). Diversity and geographical structure of //Xanthomonas citri// pv. citri on Citrus in the South West Indian Ocean Region. Microorganisms 9: 945. DOI: [[https://doi.org/10.3390/microorganisms9050945|10.3390/microorganisms9050945]] Pruvost O, Richard D, Boyer K, Javegny S, Boyer C, Chiroleu F, Grygiel P, Parvedy E, Robène I, Maillot-Lebon V, Hamza A, Lobin KK, Naiken M, Vernière C (2021). Diversity and geographical structure of //Xanthomonas citri// pv. citri on Citrus in the South West Indian Ocean Region. Microorganisms 9: 945. DOI: [[https://doi.org/10.3390/microorganisms9050945|10.3390/microorganisms9050945]]
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 +Rache L, Blondin L, Diaz Tatis P, Flores C, Camargo A, Kante M, Wonni I, López C, Szurek B, Dupas S, Pruvost O, Koebnik R, Restrepo S, Bernal A, Vernière C (2023). A minisatellite-based MLVA for deciphering the global epidemiology of the bacterial cassava pathogen //Xanthomonas phaseoli// pv. //manihotis//. PLoS One 18: e0285491. DOI: [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0285491|10.1371/journal.pone.0285491]]
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 Rademaker JL, Norman DJ, Forster RL, Louws FJ, Schultz MH, de Bruijn FJ (2006). Classification and identification of //Xanthomonas translucens// isolates, including those pathogenic to ornamental asparagus. Phytopathology 96: 876-884. DOI: [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-96-0876|10.1094/PHYTO-96-0876]] Rademaker JL, Norman DJ, Forster RL, Louws FJ, Schultz MH, de Bruijn FJ (2006). Classification and identification of //Xanthomonas translucens// isolates, including those pathogenic to ornamental asparagus. Phytopathology 96: 876-884. DOI: [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-96-0876|10.1094/PHYTO-96-0876]]
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 Timilsina S, Jibrin MO, Potnis N, Minsavage GV, Kebede M, Schwartz A, Bart R, Staskawicz B, Boyer C, Vallad GE, Pruvost O, Jones JB, Goss EM (2015). Multilocus sequence analysis of xanthomonads causing bacterial spot of tomato and pepper plants reveals strains generated by recombination among species and recent global spread of //Xanthomonas gardneri.// Appl. Environ. Microbiol. 81: 1520-1529. DOI: [[https://doi.org/10.1128/AEM.03000-14|10.1128/AEM.03000-14]] Timilsina S, Jibrin MO, Potnis N, Minsavage GV, Kebede M, Schwartz A, Bart R, Staskawicz B, Boyer C, Vallad GE, Pruvost O, Jones JB, Goss EM (2015). Multilocus sequence analysis of xanthomonads causing bacterial spot of tomato and pepper plants reveals strains generated by recombination among species and recent global spread of //Xanthomonas gardneri.// Appl. Environ. Microbiol. 81: 1520-1529. DOI: [[https://doi.org/10.1128/AEM.03000-14|10.1128/AEM.03000-14]]
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 Vancheva T, Bogatzevska N, Moncheva P, Mitrev S, Vernière C, Koebnik R (2021). Molecular epidemiology of //Xanthomonas euvesicatoria// strains from the Balkan Peninsula revealed by a new multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis scheme. Microorganisms 9: 536. DOI: [[https://doi.org/10.3390/microorganisms9030536|10.3390/microorganisms9030536]] Vancheva T, Bogatzevska N, Moncheva P, Mitrev S, Vernière C, Koebnik R (2021). Molecular epidemiology of //Xanthomonas euvesicatoria// strains from the Balkan Peninsula revealed by a new multiple-locus variable-number tandem-repeat analysis scheme. Microorganisms 9: 536. DOI: [[https://doi.org/10.3390/microorganisms9030536|10.3390/microorganisms9030536]]
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 Nunney L, Elfekih S, Stouthamer R (2012). The importance of multilocus sequence typing: cautionary tales from the bacterium //Xylella fastidiosa//. Phytopathology 102: 456-460. DOI: [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-10-11-0298|10.1094/PHYTO-10-11-0298]] Nunney L, Elfekih S, Stouthamer R (2012). The importance of multilocus sequence typing: cautionary tales from the bacterium //Xylella fastidiosa//. Phytopathology 102: 456-460. DOI: [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-10-11-0298|10.1094/PHYTO-10-11-0298]]
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