Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

--- diagnostics:dna_protocols [2026/04/13 10:20] – [References] rkoebnik
+++ diagnostics:dna_protocols [2026/08/07 10:37] (current) – [Table] rkoebnik
@@ Line 11: / Line 11: @@
 | Bacterial leaf blight and bacterial leaf streak of rice                                                                                                              | //X. oryzae// pvs. //oryzae// and //oryzicola//                                                                            | [[https://doi.org/10.1007/s002530100641|Sakthivel (2001)]], \\  [[https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18852502/|Kang (2008)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-94-3-0311|Lang (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-06-10-0399|Cho (2011)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/S2095-3119(12)60047-1|Shen (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.3389/fmicb.2015.00791|Singhal (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/jam.13094|Cui (2016)]]                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-06-10-0399|Cho (2011)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.cropro.2012.04.014|Kang (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.18699/VJGB-22-66|Koroleva (2022)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                             | [[https://doi.org/10.1128/AEM.00274-14|Lang (2014)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.cropro.2021.105809|Buddhachat (2021)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.pmpp.2022.101858|Ejaz (2022)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.bios.2022.114076|Zhu (2022)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.cropro.2023.106466|Buddhachat (2024)]], \\  [[https://doi.org/10.1021/acs.jafc.5c04360|Fei (2025)]]                                                                                                     |
 | Bacterial spot of pepper and tomato                                                                                                                                  | //X. euvesicatoria// pvs. //euvesicatoria// and //perforans//, \\ //X. hortorum// pv. //gardneri//, \\ //X. vesicatoria//  | [[https://doi.org/10.1111/j.1472-765X.2009.02690.x|Moretti (2009)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2672.2012.05431.x|Araújo (2011)]], \\  [[https://doi.org/10.1007/s10658-013-0225-4|Araújo (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.cropro.2012.08.008|Beran (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.17660/ActaHortic.2009.808.13|Koenraadt (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.cropro.2019.104978|Pečenka (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.5423/PPJ.OA.08.2022.0119|Siddique (2023)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-12-22-0479-R|Utami (2023)]]  | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-09-15-1085-RE|Strayer (2016)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.cropro.2019.104978|Pečenka (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.5423/PPJ.OA.08.2022.0119|Siddique (2023)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-12-22-0479-R|Utami (2023)]]                                                                                                                                                                                                                          | [[https://doi.org/10.1038/s41598-018-32295-4|Larrea-Sarmiento (2018)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-03-18-0101-R|Strayer-Scherer (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.3390/microorganisms8091301|Stehlíková (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-05-22-1098-RE|Beran (2023)]], \\  [[https://doi.org/10.5423/PPJ.OA.08.2022.0119|Siddique (2023)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-12-23-0481-R|Shymanovich (2024)]]                                                              |
-| Bacterial angular leaf spot of strawberry                                                                                                                            | //X. fragariae//                                                                                                           | [[https://doi.org/10.17660/ActaHortic.1997.439.136|Hartung (1997)]], \\  [[https://agris.fao.org/agris-search/search.do?recordID=IT2001060012|Cruz (1999)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.mimet.2004.04.002|Stöger (2004)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.2005.00812.x|Moltmann (2005)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-11-24-2299-RE|Wang (2025)]]                                                                                                                                                                                              | [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-98-3-0359|Turechek (2008)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/j.1365-3059.2007.01813.x|Vandroemme (2008)]], \\  [[https://doi.org/10.17660/ActaHortic.2009.842.44|Cubero (2009)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-11-24-2299-RE|Wang (2025)]]                                                                                                                                                                                                                    | [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0147122|Wang (2016)]], [[https://doi.org/10.1111/ppa.12665|Gétaz (2017)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-10-19-2248-RE|Wang (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/jph.12900|Immanuel (2020)]]                                                                                                                                                                                                                                                          |
+| Bacterial angular leaf spot of strawberry                                                                                                                            | //X. fragariae//                                                                                                           | [[https://doi.org/10.17660/ActaHortic.1997.439.136|Hartung (1997)]], \\  [[https://agris.fao.org/agris-search/search.do?recordID=IT2001060012|Cruz (1999)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.mimet.2004.04.002|Stöger (2004)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.2005.00812.x|Moltmann (2005)]],  \\ [[https://doi.org/10.1186/2046-4053-4-9|Mirmajlessi (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-11-24-2299-RE|Wang (2025)]]                                                                                                                            | [[https://doi.org/10.1016/j.mimet.2007.05.018|Weller (2007)]], \\ [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-98-3-0359|Turechek (2008)]], \\ [[https://doi.org/10.1111/j.1365-3059.2007.01813.x|Vandroemme (2008)]], \\ [[https://doi.org/10.17660/ActaHortic.2009.842.44|Cubero (2009)]], \\ [[https://doi.org/10.1186/2046-4053-4-9|Mirmajlessi (2015)]], \\ [[https://doi.org/10.1094/PDIS-11-24-2299-RE|Wang (2025)]]                                                                                    | [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0147122|Wang (2016)]], [[https://doi.org/10.1111/ppa.12665|Gétaz (2017)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-10-19-2248-RE|Wang (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/jph.12900|Immanuel (2020)]]                                                                                                                                                                                                                                                          |
 | Bacterial blight of anthurium and other aroids                                                                                                                       | //X. phaseoli// pv. //dieffenbachiae//                                                                                     | [[https://doi.org/10.1007/s10658-005-7062-z|Khoodoo (2005)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.72.2.1072-1078.2006|Robène-Soustrade (2006)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/ppa.12083|Chabirand (2014)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             | [[https://doi.org/10.1016/j.mimet.2019.03.003|Jouen (2019)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      | [[https://doi.org/10.1007/s10658-015-0653-4|Jun-Hai (2015)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
 | Bacterial leaf spot of poinsettia                                                                                                                                    | //X. axonopodis// pv. //poinsetticola//                                                                                    | [[https://doi.org/10.5423/PPJ.OA.04.2015.0049|Back (2015)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           |  NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               |  NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  |
@@ Line 149: / Line 149: @@
 Minsavage GV, Thompson CM, Hopkins DL, Leite RMVBC, Stall RE (2025). Development of a polymerase chain reaction protocol for detection of //Xylella fastidiosa// in plant tissue. Phytopathology 115: 456-461. doi: [[https://doi.org/10.1094/Phyto-84-456|10.1094/Phyto-84-456]]
+Mirmajlessi SM, Destefanis M, Gottsberger RA, Mänd M, Loit E (2015). PCR-based specific techniques used for detecting the most important pathogens on strawberry: a systematic review. Syst. Rev. 4: 9. DOI: [[https://doi.org/10.1186/2046-4053-4-9|10.1186/2046-4053-4-9]]
 Moltmann E, Zimmermann C (2005). Detection of //Xanthomonas fragariae// in symptomless strawberry plants by nested PCR. EPPO Bull. 35: 53-54. DOI: [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.2005.00812.x|10.1111/j.1365-2338.2005.00812.x]]
@@ Line 214: / Line 216: @@
 Wang H, Turechek WW (2020). Detection of viable //Xanthomonas fragariae// cells in strawberry using propidium monoazide and long-amplicon quantitative PCR. Plant Dis. 104: 1105-1112. DOI: [[https://doi.org/10.1094/PDIS-10-19-2248-RE|10.1094/PDIS-10-19-2248-RE]]
-Wang S, Wang P, Liao W, Liu X, Ouyang M, Lin S, Lin R, Xu Z, Chen G, Zhu B (2025). Rapid detection of //Xanthomonas fragariae// in strawberry using species-specific primers based on comparative genomics. Plant Dis., in press. DOI: [[https://doi.org/10.1094/PDIS-11-24-2299-RE|10.1094/PDIS-11-24-2299-RE]]
+Wang S, Wang P, Liao W, Liu X, Ouyang M, Lin S, Lin R, Xu Z, Chen G, Zhu B (2025). Rapid detection of //Xanthomonas fragariae// in strawberry using species-specific primers based on comparative genomics. Plant Dis. 109: 2197-2203. DOI: [[https://doi.org/10.1094/PDIS-11-24-2299-RE|10.1094/PDIS-11-24-2299-RE]]
 Webber JB, Putnam M, Serdani M, Pscheidt JW, Wiman NG, Stockwell VO (2020). Characterization of isolates of //Xanthomonas arboricola// pv. //corylina//, the causal agent of bacterial blight, from Oregon hazelnut orchards. J. Plant Pathol. 102: 799-812. DOI: [[https://doi.org/10.1007/s42161-020-00505-6|10.1007/s42161-020-00505-6]]
 Webster J, Kehoe MA, Nogarotto E, Falconer L, Donovan NJ, Chapman TA (2022). Using genomics to design a pathovar-specific loop-mediated isothermal amplification (LAMP) assay, for the improved detection of //Xanthomonas citri// pv. //citri//. Microorganisms 10: 1153. DOI: [[https://doi.org/10.3390/microorganisms10061153|10.3390/microorganisms10061153]]
+Weller SA, Beresford-Jones NJ, Hall J, Thwaites R, Parkinson N, Elphinstone JG (2007). Detection of //Xanthomonas fragariae// and presumptive detection of //Xanthomonas arboricola// pv. //fragariae//, from strawberry leaves, by real-time PCR. J. Microbiol. Methods 70: 379-383. DOI: [[https://doi.org/10.1016/j.mimet.2007.05.018|10.1016/j.mimet.2007.05.018]]
 Yaseen T, Drago S, Valentini F, Elbeaino T, Stampone G, Digiaro M, D’Onghia AM (2015). On-site detection of //Xylella fastidiosa// in host plants and in” spy insects” using the real-time loop-mediated isothermal amplification method. Phytopathol. Mediterr. 54: 488-496. DOI: [[https://doi.org/10.14601/Phytopathol_Mediterr-15250|10.14601/Phytopathol_Mediterr-15250]]

EuroXanth DokuWiki

User Tools

Site Tools

Differences

Page Tools