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 ^  Disease                                                                                                                                                             ^  Bacteria                                                                                                                  ^  Conventional PCR                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ^  qPCR<sup>1</sup>                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ^  IA<sup>2</sup>    Methods                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ^
 | Onion bacterial blight                                                                                                                                               | //X. euvesicatoria// pv. //alli//                                                                                          | [[https://doi.org/10.1128/AEM.02697-09|Robène-Soustrade (2010)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      | [[https://doi.org/10.1016/j.mimet.2015.04.017|Robène (2015)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     |  NA<sup>3</sup>                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      |
-| Citrus bacterial canker                                                                                                                                              | //X. citri// pv. //citri// \\ //X. aurantifolii// pathotypes B and C                                                       | [[https://doi.org/10.1094/Phyto-86-95|Hartung (1996)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.68.3.1257-1264.2002|Cubero (2002)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2672.2005.02787.x|Coletta-Filho (2006)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.micres.2005.07.005|Suk Park (2006)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/j.1365-3059.2010.02390.x|Kositcharoenkul (2011)]], \\  [[https://doi.org/10.7717/peerj.7676|Fonseca (2019)]]                                                                                                                                        | [[https://doi.org/10.1094/PHYTO.2004.94.1.61|Mavrodieva (2004)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-95-1333|Cubero (2005)]], \\  [[https://doi.org/10.1186/s12866-020-01972-8|Robène (2020)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                   | [[https://doi.org/10.1186/1471-2180-10-176|Rigano (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.3390/microorganisms10061153|Webster (2022)]], \\  [[https://doi.org/10.3390/ijms252111590|Sidireddi (2024)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                    |
+| Citrus bacterial canker                                                                                                                                              | //X. citri// pv. //citri// \\ //X. aurantifolii// pathotypes B and C                                                       | [[https://doi.org/10.1094/Phyto-86-95|Hartung (1996)]], \\  [[https://doi.org/10.1128/AEM.68.3.1257-1264.2002|Cubero (2002)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2672.2005.02787.x|Coletta-Filho (2006)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.micres.2005.07.005|Suk Park (2006)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/j.1365-3059.2010.02390.x|Kositcharoenkul (2011)]], \\  [[https://doi.org/10.7717/peerj.7676|Fonseca (2019)]]                                                                                                                                        | [[https://doi.org/10.1094/PHYTO.2004.94.1.61|Mavrodieva (2004)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-95-1333|Cubero (2005)]], \\  [[https://doi.org/10.1186/s12866-020-01972-8|Robène (2020)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                   | [[https://doi.org/10.1186/1471-2180-10-176|Rigano (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.3390/microorganisms10061153|Webster (2022)]], \\  [[https://doi.org/10.3390/ijms252111590|Sidireddi (2024)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTOFR-10-24-0120-FI|Hill (2025)]]                                                                                                                                                                                                                                 |
 | Bacterial spot of stone fruits, walnut blight, hazelnut blight                                                                                                       | //X. arboricola// pvs. //pruni//, //corylina// and //juglandis//                                                           | [[https://doi.org/10.1007/s12275-010-0072-3|Park (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-10-16-1481-RE|Fernandes (2017)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.mimet.2019.03.003|Jouen (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.1007/s42161-020-00505-6|Webber (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.3389/fpls.2023.1254107|Kałużna (2023)]]                                                                                                                                                                                                                                  | [[https://doi.org/10.1128/AEM.01593-10|Palacio-Bielsa (2011)]], \\  [[https://doi.org/10.3389/fmicb.2017.00573|Garita-Cambronero (2017)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-12-18-2253-RE|Martins (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.3389/fpls.2023.1254107|Kałużna (2023)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-01-24-0012-RE|Panth (2024)]], \\  [[https://doi.org/10.1007/s00253-024-13288-y|Sabuquillo (2024)]]                                                                             | [[https://doi.org/10.1111/j.1365-3059.2012.02654.x|Bühlmann (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.5423/PPJ.OA.07.2019.0197|Li (2021)]], \\  [[https://doi.org/10.3389/fpls.2023.1254107|Kałużna (2023)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                |
-| Bacterial leaf blight and bacterial leaf streak of rice                                                                                                              | //X. oryzae// pvs. //oryzae// and //oryzicola//                                                                            | [[https://doi.org/10.1007/s002530100641|Sakthivel (2001)]], \\  [[https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18852502/|Kang (2008)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-94-3-0311|Lang (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-06-10-0399|Cho (2011)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/S2095-3119(12)60047-1|Shen (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.3389/fmicb.2015.00791|Singhal (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/jam.13094|Cui (2016)]]                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-06-10-0399|Cho (2011)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.cropro.2012.04.014|Kang (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.18699/VJGB-22-66|Koroleva (2022)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                             | [[https://doi.org/10.1128/AEM.00274-14|Lang (2014)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.cropro.2021.105809|Buddhachat (2021)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.pmpp.2022.101858|Ejaz (2022)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.bios.2022.114076|Zhu (2022)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.cropro.2023.106466|Buddhachat (2024)]]                                                                                                                                                                  |
+| Bacterial leaf blight and bacterial leaf streak of rice                                                                                                              | //X. oryzae// pvs. //oryzae// and //oryzicola//                                                                            | [[https://doi.org/10.1007/s002530100641|Sakthivel (2001)]], \\  [[https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/18852502/|Kang (2008)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-94-3-0311|Lang (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-06-10-0399|Cho (2011)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/S2095-3119(12)60047-1|Shen (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.3389/fmicb.2015.00791|Singhal (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/jam.13094|Cui (2016)]]                                                                                                                           | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-06-10-0399|Cho (2011)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.cropro.2012.04.014|Kang (2012)]], \\  [[https://doi.org/10.18699/VJGB-22-66|Koroleva (2022)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                             | [[https://doi.org/10.1128/AEM.00274-14|Lang (2014)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.cropro.2021.105809|Buddhachat (2021)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.pmpp.2022.101858|Ejaz (2022)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.bios.2022.114076|Zhu (2022)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.cropro.2023.106466|Buddhachat (2024)]], \\  [[https://doi.org/10.1021/acs.jafc.5c04360|Fei (2025)]]                                                                                                     |
 | Bacterial spot of pepper and tomato                                                                                                                                  | //X. euvesicatoria// pvs. //euvesicatoria// and //perforans//, \\ //X. hortorum// pv. //gardneri//, \\ //X. vesicatoria//  | [[https://doi.org/10.1111/j.1472-765X.2009.02690.x|Moretti (2009)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2672.2012.05431.x|Araújo (2011)]], \\  [[https://doi.org/10.1007/s10658-013-0225-4|Araújo (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.cropro.2012.08.008|Beran (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.17660/ActaHortic.2009.808.13|Koenraadt (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.cropro.2019.104978|Pečenka (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.5423/PPJ.OA.08.2022.0119|Siddique (2023)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-12-22-0479-R|Utami (2023)]]  | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-09-15-1085-RE|Strayer (2016)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.cropro.2019.104978|Pečenka (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.5423/PPJ.OA.08.2022.0119|Siddique (2023)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-12-22-0479-R|Utami (2023)]]                                                                                                                                                                                                                          | [[https://doi.org/10.1038/s41598-018-32295-4|Larrea-Sarmiento (2018)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-03-18-0101-R|Strayer-Scherer (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.3390/microorganisms8091301|Stehlíková (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-05-22-1098-RE|Beran (2023)]], \\  [[https://doi.org/10.5423/PPJ.OA.08.2022.0119|Siddique (2023)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-12-23-0481-R|Shymanovich (2024)]]                                                              |
 | Bacterial angular leaf spot of strawberry                                                                                                                            | //X. fragariae//                                                                                                           | [[https://doi.org/10.17660/ActaHortic.1997.439.136|Hartung (1997)]], \\  [[https://agris.fao.org/agris-search/search.do?recordID=IT2001060012|Cruz (1999)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.mimet.2004.04.002|Stöger (2004)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.2005.00812.x|Moltmann (2005)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-11-24-2299-RE|Wang (2025)]]                                                                                                                                                                                              | [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-98-3-0359|Turechek (2008)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/j.1365-3059.2007.01813.x|Vandroemme (2008)]], \\  [[https://doi.org/10.17660/ActaHortic.2009.842.44|Cubero (2009)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-11-24-2299-RE|Wang (2025)]]                                                                                                                                                                                                                    | [[https://doi.org/10.1371/journal.pone.0147122|Wang (2016)]], [[https://doi.org/10.1111/ppa.12665|Gétaz (2017)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-10-19-2248-RE|Wang (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/jph.12900|Immanuel (2020)]]                                                                                                                                                                                                                                                          |
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 | Common blight of bean                                                                                                                                                | //X. phaseoli// pv. //phaseoli//, \\ //X. citri// pv. //fuscans//                                                          | [[https://doi.org/10.1094/Phyto-86-361|Audy (1996)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  |  NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-02-19-0325-RE|De Paiva (2020)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       |
 | Cassava bacterial blight                                                                                                                                             | //X. phaseoli// pv. //manihotis//                                                                                          |  NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   |  NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               | [[https://doi.org/10.1094/PDIS-08-23-1507-RE|Bispo Carvalho (2024)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 |
-| Alfalfa dwarf, Citrus variegated chlorosis, coffee leaf scorch, oleander leaf scorch, olive quick decline syndrome, phony peach disease, Pierce's disease of grapes  | //Xylella fastidiosa//                                                                                                     | [[https://doi.org/10.1128/AEM.03299-15|Jacques (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-09-20-1900-RE|Aguilar-Granados (2021)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   | [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-06-10-0168|Harper (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.mimet.2019.05.010|Dupas (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.mimet.2020.105992|Elbeaino (2020)]],  \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-09-20-1900-RE|Aguilar-Granados (2021)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/jam.14903|Hodgetts (2021)]], \\  [[https://doi.org/10.1007/978-1-0716-2517-0_13|Hodgetts (2022)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-12-24-2568-RE|Del Pilar Velasco Amo (2025)]]  | [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-06-10-0168|Harper (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.14601/Phytopathol_Mediterr-15250|Yaseen (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1186/s13568-019-0774-9|Aglietti (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.mimet.2020.105992|Elbeaino (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.3390/agriculture13020448|Amoia (2023)]], \\  [[https://doi.org/10.1007/s13313-023-00954-4|Farrall (2024)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-12-24-2568-RE|Del Pilar Velasco Amo (2025)]]  |
+| Alfalfa dwarf, Citrus variegated chlorosis, coffee leaf scorch, oleander leaf scorch, olive quick decline syndrome, phony peach disease, Pierce's disease of grapes  | //Xylella fastidiosa//                                                                                                     | [[https://doi.org/10.1128/AEM.03299-15|Jacques (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-09-20-1900-RE|Aguilar-Granados (2021)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/Phyto-84-456|Minsavage (2025)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    | [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-06-10-0168|Harper (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.mimet.2019.05.010|Dupas (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.mimet.2020.105992|Elbeaino (2020)]],  \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-09-20-1900-RE|Aguilar-Granados (2021)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/jam.14903|Hodgetts (2021)]], \\  [[https://doi.org/10.1007/978-1-0716-2517-0_13|Hodgetts (2022)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-12-24-2568-RE|Del Pilar Velasco Amo (2025)]]  | [[https://doi.org/10.1094/PHYTO-06-10-0168|Harper (2010)]], \\  [[https://doi.org/10.14601/Phytopathol_Mediterr-15250|Yaseen (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1186/s13568-019-0774-9|Aglietti (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.1016/j.mimet.2020.105992|Elbeaino (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.3390/agriculture13020448|Amoia (2023)]], \\  [[https://doi.org/10.1007/s13313-023-00954-4|Farrall (2024)]], \\  [[https://doi.org/10.1094/PDIS-12-24-2568-RE|Del Pilar Velasco Amo (2025)]]  |
 <sup>1</sup>  qPCR: quantitative real-time PCR; <sup>2</sup>  IA: isothermal amplification: <sup>3</sup>  NA: not applicable.
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