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diagnostics:disease_regulation_management

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diagnostics:disease_regulation_management [2026/07/06 09:45] – [Table] rkoebnikdiagnostics:disease_regulation_management [2026/07/06 10:54] (current) rkoebnik
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-====== Phytosanitary-Regulated Xanthomonas in the European Union ======+====== Phytosanitary-Regulated Xanthomonads in the European Union ======
  
 This data is based on the review by [[https://doi.org/10.3390/microorganisms9040862|Catara et al. (2021)]], focused on the molecular methods for diagnosis, detection, and studies on the diversity of plant pathogenic //Xanthomonas//, concentrating especially on regulated pathogens in the European Union published as a collective effort of the [[https://euroxanth.eu/management/wg1|Working Group 1]] 'Diagnostics & Diversity–Population Structure' from the [[https://euroxanth.eu|EuroXanth]] COST Action CA16107. This data is based on the review by [[https://doi.org/10.3390/microorganisms9040862|Catara et al. (2021)]], focused on the molecular methods for diagnosis, detection, and studies on the diversity of plant pathogenic //Xanthomonas//, concentrating especially on regulated pathogens in the European Union published as a collective effort of the [[https://euroxanth.eu/management/wg1|Working Group 1]] 'Diagnostics & Diversity–Population Structure' from the [[https://euroxanth.eu|EuroXanth]] COST Action CA16107.
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 **Diseases, their regulation and recommendations for management.** **Diseases, their regulation and recommendations for management.**
  
-^  Disease                                                                                                                                                             ^  Pathogen                                                      ^  EPPO List  ^  EPPO Diagnostic \\ Protocol                                                                                                                                                                     ^  Commission Implementing Regulation (EU) 2019/2072  ^  EFSA \\ Documents                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ^ +^  Disease  ^  Pathogen  ^  EPPO List  ^  EPPO Diagnostic \\ Protocol  ^  Commission Implementing Regulation (EU) 2019/2072  ^  EFSA \\ Documents  | 
-| Citrus bacterial canker                                                                                                                                              | //X. citri// pv. //aurantifolii//; //X. citri// pv. //citri//  |  A1         | [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.2005.00835.x|EPPO (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/epp.12913|EPPO (2023a)]]                                                                         |  A1 Quarantine pest (Annex II A)                    | [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2014.3556|EFSA PLH Panel (2014a)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/sp.efsa.2019.EN-1587|EFSA PLH Panel (2019c)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/sp.efsa.2025.EN-9399|EFSA (2025d)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            +|Citrus bacterial canker |//X. citri// pv. //aurantifolii//; //X. citri// pv. //citri//   |  A1  |[[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.2005.00835.x|EPPO (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/epp.12913|EPPO (2023a)]] |  A1 Quarantine pest (Annex II A)  |[[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2014.3556|EFSA PLH Panel (2014a)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/sp.efsa.2019.EN-1587|EFSA PLH Panel (2019c)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/sp.efsa.2025.EN-9399|EFSA (2025d)]] | 
-| Onion bacterial blight                                                                                                                                               | //X. euvesicatoria// pv. //alli//                              |  A1         | [[https://doi.org/10.1111/epp.12329|EPPO (2016)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   +|Onion bacterial blight |//X. euvesicatoria// pv. //alli//   |  A1  |[[https://doi.org/10.1111/epp.12329|EPPO (2016)]] |   
-| Bacterial leaf blight of rice                                                                                                                                        | //X. oryzae// pv. //oryzae//                                   |  A1         | [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.1980.tb02685.x|EPPO (1980)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.2007.01162.x|EPPO (2007)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/epp.12474|EPPO (2018)]]  |  A1 Quarantine pest (Annex II A)                    | [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2018.5109|EFSA PLH Panel (2018a)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            +|Bacterial leaf blight of rice |//X. oryzae// pv. //oryzae//   |  A1  |[[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.1980.tb02685.x|EPPO (1980)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.2007.01162.x|EPPO (2007)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/epp.12474|EPPO (2018)]] |  A1 Quarantine pest (Annex II A)  |[[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2018.5109|EFSA PLH Panel (2018a)]] | 
-| Bacterial leaf streak of rice                                                                                                                                        | //X. oryzae// pv. //oryzicola//                                |  A1         | [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.1979.tb02445.x|EPPO (1979)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.2007.01162.x|EPPO (2007)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/epp.12474|EPPO (2018)]]  |  A1 Quarantine pest (Annex II A)                    | [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2018.5109|EFSA PLH Panel (2018a)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            +|Bacterial leaf streak of rice |//X. oryzae// pv. //oryzicola//   |  A1  |[[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.1979.tb02445.x|EPPO (1979)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.2007.01162.x|EPPO (2007)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/epp.12474|EPPO (2018)]] |  A1 Quarantine pest (Annex II A)  |[[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2018.5109|EFSA PLH Panel (2018a)]] | 
-| Bacterial blight of hazelnut                                                                                                                                         | //X. arboricola// pv. //corylina//                             |  A2         | [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.2004.00716.x|EPPO (2004)]]                                                                                                                                 |  RNQP (Annex IV)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   +|Bacterial blight of hazelnut |//X. arboricola// pv. //corylina//   |  A2  |[[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.2004.00716.x|EPPO (2004)]] |  RNQP (Annex IV)   
-| Bacterial spot of stone fruits                                                                                                                                       | //X. arboricola// pv. //pruni//                                |  A2         | [[https://doi.org/10.1111/epp.12756|EPPO (2021)]]                                                                                                                                                |  RNQP (Annex IV)                                    | [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2014.3857|EFSA PLH Panel (2014b)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            +|Bacterial spot of stone fruits |//X. arboricola// pv. //pruni//   |  A2  |[[https://doi.org/10.1111/epp.12756|EPPO (2021)]] |  RNQP (Annex IV)  |[[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2014.3857|EFSA PLH Panel (2014b)]] | 
-| Bacterial blight of walnut                                                                                                                                           | //X. arboricola// pv. //juglandis//                            |  NA         |  NA                                                                                                                                                                                              |  RNQP (Annex IV)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   +|Bacterial blight of walnut |//X. arboricola// pv. //juglandis//   |  NA  |  NA  |  RNQP (Annex IV)   
-| Bacterial leaf spot of poinsettia                                                                                                                                    | //X. axonopodis// pv. //poinsettiicola//                       |  A2         |  NA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 +|Bacterial leaf spot of poinsettia |//X. axonopodis// pv. //poinsettiicola//   |  A2  |  NA    
-| Bacterial spot of tomato and sweet pepper                                                                                                                            | //X. euvesicatoria// pv. //euvesicatoria//                     |  A2         | [[https://doi.org/10.1111/epp.12018|EPPO (2013)]]*                                                                                                                                               |  RNQP (Annex IV)                                    | [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2014.3720|EFSA PLH Panel (2014c)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            +|Bacterial spot of tomato and sweet pepper |//X. euvesicatoria// pv. //euvesicatoria//   |  A2  |[[https://doi.org/10.1111/epp.12018|EPPO (2013)]]* |  RNQP (Annex IV)  |[[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2014.3720|EFSA PLH Panel (2014c)]] | 
-| :::                                                                                                                                                                  | //X. euvesicatoria// pv. //perforans//                         |  A2         | [[https://doi.org/10.1111/epp.12018|EPPO (2013)]]*                                                                                                                                               |  RNQP (Annex IV)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   +|::: | //X. euvesicatoria// pv. //perforans//   |  A2  |[[https://doi.org/10.1111/epp.12018|EPPO (2013)]]* |  RNQP (Annex IV)   
-| :::                                                                                                                                                                  | //X. hortorum// pv. //gardneri//                               |  A2         | [[https://doi.org/10.1111/epp.12018|EPPO (2013)]]*                                                                                                                                               |  RNQP (Annex IV)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   +|::: | //X. hortorum// pv. //gardneri//   |  A2  |[[https://doi.org/10.1111/epp.12018|EPPO (2013)]]* |  RNQP (Annex IV)   
-| :::                                                                                                                                                                  | //X. vesicatoria//                                             |  A2         | [[https://doi.org/10.1111/epp.12018|EPPO (2013)]]*                                                                                                                                               |  RNQP (Annex IV)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   +|::: | //X. vesicatoria//   |  A2  |[[https://doi.org/10.1111/epp.12018|EPPO (2013)]]* |  RNQP (Annex IV)   
-| Bacterial angular leaf spot of strawberry                                                                                                                            | //X. fragariae//                                               |  A2         | [[https://doi.org/10.1111/epp.12916|EPPO (2023b)]]                                                                                                                                               |  RNQP (Annex IV)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   +|Bacterial angular leaf spot of strawberry |//X. fragariae//   |  A2  |[[https://doi.org/10.1111/epp.12916|EPPO (2023b)]] |  RNQP (Annex IV)   
-| Bacterial blight of anthurium and other aroids                                                                                                                       | //X. phaseoli// pv. //dieffenbachiae//                         |  A2         | [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.2009.02327.x|EPPO (2009)]]*                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   +|Bacterial blight of anthurium and other aroids |//X. phaseoli// pv. //dieffenbachiae//   |  A2  |[[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.2009.02327.x|EPPO (2009)]]* |   
-| Common bacterial blight of bean                                                                                                                                      | //X. phaseoli// pv. //phaseoli//                               |  A2         |  NA                                                                                                                                                                                              |  RNQP (Annex IV)                                    | [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2014.3856|EFSA PLH Panel (2014d)]]                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            +|Common bacterial blight of bean |//X. phaseoli// pv. //phaseoli//   |  A2  |  NA  |  RNQP (Annex IV)  |[[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2014.3856|EFSA PLH Panel (2014d)]] | 
-| Bacterial leaf streak and black chaff of small-grain cereals                                                                                                         | //X. translucens// pv. //translucens//                         |  A2         | [[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.1994.tb01057.x|EPPO (1994)]]*                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 +|Bacterial leaf streak and black chaff of small-grain cereals |//X. translucens// pv. //translucens//   |  A2  |[[https://doi.org/10.1111/j.1365-2338.1994.tb01057.x|EPPO (1994)]]* |   
-| Leafspot and dieback of ornamental fig                                                                                                                               | //X. campestris// pv. //fici//                                             |  NA                                                                                                                                                                                              |  RNQP (Annex IV)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   +|Leafspot and dieback of ornamental fig |//X. campestris// pv. //fici//    |  NA  |  RNQP (Annex IV)   
-| Alfalfa dwarf, Citrus variegated chlorosis, coffee leaf scorch, oleander leaf scorch, olive quick decline syndrome, phony peach disease, Pierce's disease of grapes  | //Xylella fastidiosa//                                         |  A2         | [[https://doi.org/10.1111/epp.12575|EPPO (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/epp.12923|EPPO (2023c)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/epp.13060|EPPO (2024)]]                                 |  A2 Quarantine pest (Annex II B)                    | [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2013.3468|EFSA (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2015.4061|EFSA (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2015.3989|EFSA PLH Panel (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2016.4450|EFSA PLH Panel (2016a)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2016.4456|EFSA PLH Panel (2016b)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2018.5357|EFSA PLH Panel (2018b)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/sp.efsa.2019.EN-1667|EFSA (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2019.5665|EFSA PLH Panel (2019a)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2019.5666|EFSA PLH Panel (2019b)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/sp.efsa.2020.EN-1873|EFSA (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2024.8898|EFSA (2024)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/sp.efsa.2025.EN-9244|EFSA (2025a)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2025.9241|EFSA (2025b)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2025.9563|EFSA (2025c)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2026.9840|EFSA (2026a)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2026.10147|EFSA (2026b)]]  |+|Alfalfa dwarf, Citrus variegated chlorosis, coffee leaf scorch, oleander leaf scorch, olive quick decline syndrome, phony peach disease, Pierce's disease of grapes |//Xylella fastidiosa//   |  A2  |[[https://doi.org/10.1111/epp.12575|EPPO (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/epp.12923|EPPO (2023c)]], \\  [[https://doi.org/10.1111/epp.13060|EPPO (2024)]] |  A2 Quarantine pest (Annex II B)  |[[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2013.3468|EFSA (2013)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2015.4061|EFSA (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2015.3989|EFSA PLH Panel (2015)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2016.4450|EFSA PLH Panel (2016a)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2016.4456|EFSA PLH Panel (2016b)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2018.5357|EFSA PLH Panel (2018b)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/sp.efsa.2019.EN-1667|EFSA (2019)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2019.5665|EFSA PLH Panel (2019a)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2019.5666|EFSA PLH Panel (2019b)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/sp.efsa.2020.EN-1873|EFSA (2020)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2024.8898|EFSA (2024)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/sp.efsa.2025.EN-9244|EFSA (2025a)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2025.9241|EFSA (2025b)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2025.9563|EFSA (2025c)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2026.9840|EFSA (2026a)]], \\  [[https://doi.org/10.2903/j.efsa.2026.10147|EFSA (2026b)]] |
  
 NA: not applicable; * protocol under revision or revision planned. International Seed Testing Association (ISTA), International Seed Federation (ISF), United States Department of Agriculture (USDA), and National Seed Health System (NSHS). Other sources of reviewed detection methods include scientific publications of EFSA (‘Scientific Opinions’, ‘Pest Survey Cards’, etc) and other peer-reviewed scientific journals. NA: not applicable; * protocol under revision or revision planned. International Seed Testing Association (ISTA), International Seed Federation (ISF), United States Department of Agriculture (USDA), and National Seed Health System (NSHS). Other sources of reviewed detection methods include scientific publications of EFSA (‘Scientific Opinions’, ‘Pest Survey Cards’, etc) and other peer-reviewed scientific journals.
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 European and Mediterranean Plant Protection Organization (EPPO) (2024). Corrigendum PM 7/024 (5) //Xylella fastidiosa//. EPPO Bull. 54: 391-392. DOI: [[https://doi.org/10.1111/epp.13060|10.1111/epp.13060]] European and Mediterranean Plant Protection Organization (EPPO) (2024). Corrigendum PM 7/024 (5) //Xylella fastidiosa//. EPPO Bull. 54: 391-392. DOI: [[https://doi.org/10.1111/epp.13060|10.1111/epp.13060]]
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diagnostics/disease_regulation_management.txt · Last modified: 2026/07/06 10:54 by rkoebnik