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bacteria:t3e:t3e [2024/03/16 11:31] – [Type 3 effectors] rkoebnikbacteria:t3e:t3e [2025/02/27 15:19] (current) – [Table] rkoebnik
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-====== Type III effectors ======+====== Type III effectors from //Xanthomonas// ======
  
 [[http://www.biopred.net/xanthomonas/|Link to the original Xanthomonas //Resource @ xanthomonas.org]] [[http://www.biopred.net/xanthomonas/|Link to the original Xanthomonas //Resource @ xanthomonas.org]]
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 [[:bacteria:t3e:effectors|Multi-FASTA-formatted list of type III effectors from Xanthomonas]] [[:bacteria:t3e:effectors|Multi-FASTA-formatted list of type III effectors from Xanthomonas]]
  
-[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011037255.1, WP_039418336.1, WP_011052943.1, WP_039417318.1, WP_011347616.1, WP_041183113.1, WP_228949438.1, WP_011345998.1, WP_011347479.1, WP_011052114.1, WP_244170787.1, WP_260607984.1, WP_011346095.1, WP_011348008.1, WP_039005675.1, WP_011346758.1, WP_011038360.1, WP_084217840.1, WP_011345706.1, WP_010377341.1, WP_011346406.1, WP_010367684.1, WP_011347382.1, WP_074052319.1, WP_011346137.1, WP_008572727.1, WP_228442257.1, WP_027703763.1, WP_218498620.1, WP_011346113.1, WP_011348010.1, WP_011346566.1, WP_104613784.1, WP_011349176.1, WP_011260681.1, WP_039418869.1, WP_199285673.1, WP_011408937.1, WP_011409498.1, WP_228329674.1, WP_011346212.1, WP_011408080.1, WP_011259177.1, WP_039421390.1, WP_041855088.1, WP_011409110.1, WP_011269629.1, WP_011409710.1, WP_011050288.1, WP_008577605.1, WP_227479740.1, WP_272820829.1, WP_007970248.1, WP_011037263.1, WP_011052119.1, WP_014504815.1, WP_269466020.1, WP_274360846.1, WP_012437264.1, WP_012438997.1, WP_162267513.1, WP_236504155.1, WP_233366621.1, APO95022.1, WP_229015407.1, AEL06363.1, WP_041855031.1, WP_065628638.1, WP_011269951.1, WP_011348129.1, WP_041854960.1, WP_104549896.1, WP_227478587.1, WP_251761698.1, WP_145953988.1?report=fasta|List of type III effectors in Xanthomonas]] (for download from NCBI)+[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011037255.1, WP_039418336.1, WP_011052943.1, WP_039417318.1, WP_011347616.1, WP_041183113.1, WP_228949438.1, WP_011345998.1, WP_011347479.1, WP_011052114.1, WP_244170787.1, WP_260607984.1, WP_011346095.1, WP_011348008.1, WP_039005675.1, WP_011346758.1, WP_011038360.1, WP_084217840.1, WP_011345706.1, WP_010377341.1, WP_011346406.1, WP_010367684.1, WP_011347382.1, WP_074052319.1, WP_011346137.1, WP_008572727.1, WP_228442257.1, WP_196765268.1, WP_027703763.1, WP_218498620.1, WP_011346113.1, WP_011348010.1, WP_011346566.1, WP_104613784.1, WP_011349176.1, WP_011260681.1, WP_039418869.1, WP_199285673.1, WP_011408937.1, WP_011409498.1, WP_228329674.1, WP_011346212.1, WP_011408080.1, WP_011259177.1, WP_039421390.1, WP_041855088.1, WP_011409110.1, WP_011269629.1, WP_011409710.1, WP_011050288.1, WP_008577605.1, WP_227479740.1, WP_272820829.1, WP_007970248.1, WP_011037263.1, WP_011052119.1, WP_014504815.1, WP_269466020.1, WP_274360846.1, WP_012437264.1, WP_012438997.1, WP_162267513.1, WP_236504155.1, WP_233366621.1, APO95022.1, WP_229015407.1, AEL06363.1, WP_041855031.1, WP_065628638.1, WP_011269951.1, WP_011348129.1, WP_041854960.1, WP_104549896.1, WP_227478587.1, WP_251761698.1, WP_145953988.1?report=fasta|List of type III effectors in Xanthomonas]] (for download from NCBI)
  
 [[http://www.pseudomonas-syringae.org|Pseudomonas–Plant Interaction website]] (Lindeberg //et al.//, 2005) [[http://www.pseudomonas-syringae.org|Pseudomonas–Plant Interaction website]] (Lindeberg //et al.//, 2005)
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 [[:bacteria:t3e:t3e_template|Empty template]] - [[:bacteria:t3e:xopau|Example 1: XopAU]] - [[:bacteria:t3e:xopb|Example 2: XopB]] [[:bacteria:t3e:t3e_template|Empty template]] - [[:bacteria:t3e:xopau|Example 1: XopAU]] - [[:bacteria:t3e:xopb|Example 2: XopB]]
  
-===== Xanthomonas type 3 effectors =====+===== Xanthomonas type III effectors =====
  
-^Class ^Family ^Synonyms ^Related proteins ^RefSeq ID (GenBank ID) ^Function / Features | +<datatables page-length="100"> 
-|AvrBs1 |[[:bacteria:t3e:avrbs1|AvrBs1]] |  |AvrA |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011037255.1|WP_011037255.1]] |  | +^ Class   ^ Family                           ^ Synonyms                                        ^ Related proteins                                      ^ RefSeq ID (GenBank ID)                                                  ^ Function / Features                                                                                                                                                                                                                                                                     ^ 
-|AvrBs2 |[[:bacteria:t3e:avrbs2|AvrBs2]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_039418336.1|WP_039418336.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR030395/|Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain]] | +| AvrBs1  | [[:bacteria:t3e:avrbs1|AvrBs1]]  |                                                 | AvrA                                                  | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011037255.1|WP_011037255.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|AvrBs3 |[[:bacteria:t3e:avrbs3|AvrBs3]] |PthA, PthB, PthN, PthXo, AvrXa7, AvrXa27, TALE |RipTAL |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011052943.1|WP_011052943.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005042/|TAL effector repeat]]; Transcription activator in eukaryotic host cell; Nuclear localization | +| AvrBs2  | [[:bacteria:t3e:avrbs2|AvrBs2]]  |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_039418336.1|WP_039418336.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR030395/|Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain]]                                                                                                                                                                             | 
-|XopB |[[:bacteria:t3e:xopb|XopB]] |  |HopD1 (HopPtoD1, AvrPphD1), RipD |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_039417318.1|WP_039417318.1]] |  | +| AvrBs3  | [[:bacteria:t3e:avrbs3|AvrBs3]]  | PthA, PthB, PthN, PthXo, AvrXa7, AvrXa27, TALE  | RipTAL                                                | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011052943.1|WP_011052943.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005042/|TAL effector repeat]]; Transcription activator in eukaryotic host cell; Nuclear localization                                                                                                                                 | 
-|XopC |[[:bacteria:t3e:xopc|XopC1]] |  |RipC2 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011347616.1|WP_011347616.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR000836/|Phosphoribosyltransferase domain]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR041492/|Haloacid dehalogenase-like hydrolase]] | +| XopB    | [[:bacteria:t3e:xopb|XopB]]      |                                                 | HopD1 (HopPtoD1, AvrPphD1), RipD                      | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_039417318.1|WP_039417318.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopC |[[:bacteria:t3e:xopc|XopC2]] |  |RipC1 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_041183113.1|WP_041183113.1]] |  | +| XopC    | [[:bacteria:t3e:xopc|XopC1]]     |                                                 | RipC2                                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011347616.1|WP_011347616.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR000836/|Phosphoribosyltransferase domain]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR041492/|Haloacid dehalogenase-like hydrolase]]                                                                                        | 
-|XopD |[[:bacteria:t3e:xopd|XopD]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_228949438.1|WP_228949438.1]] |C48-family SUMO cysteine protease ([[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR003653/|Ulp1 protease family]]); EAR motif; DNA binding; Nuclear localization | +| XopC    | [[:bacteria:t3e:xopc|XopC2]]     |                                                 | RipC1                                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_041183113.1|WP_041183113.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopE |[[:bacteria:t3e:xope1|XopE1]] |AvrXacE1 |HopX (AvrPphE), RipE1 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011345998.1|WP_011345998.1]] |Putative transglutaminase | +| XopD    | [[:bacteria:t3e:xopd|XopD]]      |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_228949438.1|WP_228949438.1]]  | C48-family SUMO cysteine protease ([[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR003653/|Ulp1 protease family]]); EAR motif; DNA binding; Nuclear localization                                                                                                                     | 
-|XopE |[[:bacteria:t3e:xope2|XopE2]] |AvrXacE3, AvrXccE1 |HopX (AvrPphE), RipE1 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011347479.1|WP_011347479.1]] |Putative transglutaminase | +| XopE    | [[:bacteria:t3e:xope1|XopE1]]    | AvrXacE1                                        | HopX (AvrPphE), RipE1                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011345998.1|WP_011345998.1]]  | Putative transglutaminase                                                                                                                                                                                                                                                               | 
-|XopE |[[:bacteria:t3e:xope3|XopE3]] |AvrXacE2 |HopX (AvrPphE), RipE1 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011052114.1|WP_011052114.1]] |Putative transglutaminase | +| XopE    | [[:bacteria:t3e:xope2|XopE2]]    | AvrXacE3, AvrXccE1                              | HopX (AvrPphE), RipE1                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011347479.1|WP_011347479.1]]  | Putative transglutaminase                                                                                                                                                                                                                                                               | 
-|XopE |[[:bacteria:t3e:xope4|XopE4]] |  |RipE1 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_244170787.1|WP_244170787.1]] |Putative transglutaminase | +| XopE    | [[:bacteria:t3e:xope3|XopE3]]    | AvrXacE2                                        | HopX (AvrPphE), RipE1                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011052114.1|WP_011052114.1]]  | Putative transglutaminase                                                                                                                                                                                                                                                               | 
-|XopE |[[:bacteria:t3e:xope5|XopE5]] |  |HopX (AvrPphE), RipE1 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_260607984.1|WP_260607984.1]] |Putative transglutaminase | +| XopE    | [[:bacteria:t3e:xope4|XopE4]]    |                                                 | RipE1                                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_244170787.1|WP_244170787.1]]  | Putative transglutaminase                                                                                                                                                                                                                                                               | 
-|XopF |[[:bacteria:t3e:xopf|XopF1]] |Hpa4 |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011346095.1|WP_011346095.1]] |  | +| XopE    | [[:bacteria:t3e:xope5|XopE5]]    |                                                 | HopX (AvrPphE), RipE1                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_260607984.1|WP_260607984.1]]  | Putative transglutaminase                                                                                                                                                                                                                                                               | 
-|XopF |[[:bacteria:t3e:xopf|XopF2]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011348008.1|WP_011348008.1]] |  | +| XopF    | [[:bacteria:t3e:xopf|XopF1]]     | Hpa4                                            |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011346095.1|WP_011346095.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopF |[[:bacteria:t3e:xopf|XopF3]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_039005675.1|WP_039005675.1]] |  | +| XopF    | [[:bacteria:t3e:xopf|XopF2]]     |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011348008.1|WP_011348008.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopG |[[:bacteria:t3e:xopg|XopG1]] |  |HopH (HopPtoH), RipAX2 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011346758.1|WP_011346758.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF14891/|Peptidase_M91 superfamily]]; HEXXH motif, typical of zinc metallopeptidases | +| XopF    | [[:bacteria:t3e:xopf|XopF3]]     |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_039005675.1|WP_039005675.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopG |[[:bacteria:t3e:xopg|XopG2]] |  |HopH (HopPtoH), RipAX2 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011038360.1|WP_011038360.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF14891/|Peptidase_M91 superfamily]]; HEXXH motif, typical of zinc metallopeptidases | +| XopG    | [[:bacteria:t3e:xopg|XopG1]]     |                                                 | HopH (HopPtoH), RipAX2                                | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011346758.1|WP_011346758.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF14891/|Peptidase_M91 superfamily]]; HEXXH motif, typical of zinc metallopeptidases                                                                                                                                                        | 
-|XopG |[[:bacteria:t3e:xopg|XopG3]] |  |HopH (HopPtoH), RipAX1 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_084217840.1|WP_084217840.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF14891/|Peptidase_M91 superfamily]]; HEXXH motif, typical of zinc metallopeptidases | +| XopG    | [[:bacteria:t3e:xopg|XopG2]]     |                                                 | HopH (HopPtoH), RipAX2                                | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011038360.1|WP_011038360.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF14891/|Peptidase_M91 superfamily]]; HEXXH motif, typical of zinc metallopeptidases                                                                                                                                                        | 
-|XopH |[[:bacteria:t3e:xoph|XopH1]] |AvrBs1.1, AvrBs7 |HopAO1 (HopPtoD2), RipBL |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011345706.1|WP_011345706.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF14566/|Protein tyrosine phosphatase-like phytase]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR000387/|Tyrosine-specific protein phosphatase]] | +| XopG    | [[:bacteria:t3e:xopg|XopG3]]     |                                                 | HopH (HopPtoH), RipAX1                                | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_084217840.1|WP_084217840.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF14891/|Peptidase_M91 superfamily]]; HEXXH motif, typical of zinc metallopeptidases                                                                                                                                                        | 
-|XopH |[[:bacteria:t3e:xoph|XopH2]] |  |HopAO1 (HopPtoD2), RipBL |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_010377341.1|WP_010377341.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF14566/|Protein tyrosine phosphatase-like phytase]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR000387/|Tyrosine-specific protein phosphatase]] | +| XopH    | [[:bacteria:t3e:xoph|XopH1]]     | AvrBs1.1, AvrBs7                                | HopAO1 (HopPtoD2), RipBL                              | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011345706.1|WP_011345706.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF14566/|Protein tyrosine phosphatase-like phytase]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR000387/|Tyrosine-specific protein phosphatase]]                                                                                    | 
-|XopI |[[:bacteria:t3e:xopi|XopI1]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011346406.1|WP_011346406.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR001810/|F-box domain]] | +| XopH    | [[:bacteria:t3e:xoph|XopH2]]     |                                                 | HopAO1 (HopPtoD2), RipBL                              | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_010377341.1|WP_010377341.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF14566/|Protein tyrosine phosphatase-like phytase]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR000387/|Tyrosine-specific protein phosphatase]]                                                                                    | 
-|XopI |[[:bacteria:t3e:xopi|XopI2]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_010367684.1|WP_010367684.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR001810/|F-box domain]] | +| XopI    | [[:bacteria:t3e:xopi|XopI1]]     |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011346406.1|WP_011346406.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR001810/|F-box domain]]                                                                                                                                                                                                               | 
-|XopJ |[[:bacteria:t3e:xopj1|XopJ1]] |  |HopZ1, RipP1 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011347382.1|WP_011347382.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]] | +| XopI    | [[:bacteria:t3e:xopi|XopI2]]     |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_010367684.1|WP_010367684.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR001810/|F-box domain]]                                                                                                                                                                                                               | 
-|XopJ |[[:bacteria:t3e:xopj2|XopJ2]] |AvrBsT |HopZ1, RipP1 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_074052319.1|WP_074052319.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]] | +| XopJ    | [[:bacteria:t3e:xopj1|XopJ1]]    |                                                 | HopZ1, RipP1                                          | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011347382.1|WP_011347382.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]]                                                                                                                                                                                                  | 
-|XopJ |[[:bacteria:t3e:xopj3|XopJ3]] |AvrRxv |HopZ1, RipP1 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011346137.1|WP_011346137.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]] | +| XopJ    | [[:bacteria:t3e:xopj2|XopJ2]]    | AvrBsT                                          | HopZ1, RipP1                                          | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_074052319.1|WP_074052319.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]]                                                                                                                                                                                                  | 
-|XopJ |[[:bacteria:t3e:xopj4|XopJ4]] |AvrXv4 |HopZ1, RipP1 (formerly PopP1) |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_008572727.1|WP_008572727.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]] | +| XopJ    | [[:bacteria:t3e:xopj3|XopJ3]]    | AvrRxv                                          | HopZ1, RipP1                                          | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011346137.1|WP_011346137.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]]                                                                                                                                                                                                  | 
-|XopJ |[[:bacteria:t3e:xopj5|XopJ5]] |AvrXccB |HopZ1, RipK, RipP1 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_228442257.1|WP_228442257.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]] | +| XopJ    | [[:bacteria:t3e:xopj4|XopJ4]]    | AvrXv4                                          | HopZ1, RipP1 (formerly PopP1)                         | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_008572727.1|WP_008572727.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]]                                                                                                                                                                                                  | 
-|XopJ |[[:bacteria:t3e:xopj6|XopJ6]] |  |  |  |Unpublished, personal communication | +| XopJ    | [[:bacteria:t3e:xopj5|XopJ5]]    | AvrXccB                                         | HopZ1, RipK, RipP1                                    | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_228442257.1|WP_228442257.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]]                                                                                                                                                                                                  | 
-|XopK |[[:bacteria:t3e:xopk|XopK]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_027703763.1|WP_027703763.1]] |  | +| XopJ    | [[:bacteria:t3e:xopj6|XopJ6]]    |                                                 | RipP2 (formerly PopP2)                                | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_196765268.1|WP_196765268.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]]                                                                                                                                                                                                  | 
-|XopL |[[:bacteria:t3e:xopl|XopL]] |  |RipAC (formerly PopC) |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_218498620.1|WP_218498620.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR003591/|LRR motif]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR001611/|LRR domain]] | +| XopK    | [[:bacteria:t3e:xopk|XopK]]      |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_027703763.1|WP_027703763.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopM |[[:bacteria:t3e:xopm|XopM]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011346113.1|WP_011346113.1]] |  | +| XopL    | [[:bacteria:t3e:xopl|XopL]]      |                                                 | RipAC (formerly PopC)                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_218498620.1|WP_218498620.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR003591/|LRR motif]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR001611/|LRR domain]]                                                                                                                                         | 
-|XopN |[[:bacteria:t3e:xopn|XopN]] |  |HopAU1 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011348010.1|WP_011348010.1]] |ARM/HEAT repeat | +| XopM    | [[:bacteria:t3e:xopm|XopM]]      |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011346113.1|WP_011346113.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopO |[[:bacteria:t3e:xopo|XopO]] |  |HopK1 (HopPtoK, HolPtoAB) N-terminal domain, AvrRps4 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011346566.1|WP_011346566.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/cdd/CD21837/|AvrRps4 C-terminal region]] | +| XopN    | [[:bacteria:t3e:xopn|XopN]]      |                                                 | HopAU1                                                | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011348010.1|WP_011348010.1]]  | ARM/HEAT repeat                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopP |[[:bacteria:t3e:xopp|XopP]] |  |RipH3 (formerly Hlk) |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_104613784.1|WP_104613784.1]] |  | +| XopO    | [[:bacteria:t3e:xopo|XopO]]      |                                                 | HopK1 (HopPtoK, HolPtoAB) N-terminal domain, AvrRps4  | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011346566.1|WP_011346566.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/cdd/CD21837/|AvrRps4 C-terminal region]]                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopQ |[[:bacteria:t3e:xopq|XopQ]] |  |HopQ1 (HolPtoQ), RipB |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011349176.1|WP_011349176.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR001910/|Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase]] | +| XopP    | [[:bacteria:t3e:xopp|XopP]]      |                                                 | RipH3 (formerly Hlk)                                  | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_104613784.1|WP_104613784.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopR |[[:bacteria:t3e:xopr|XopR]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011260681.1|WP_011260681.1]] |  | +| XopQ    | [[:bacteria:t3e:xopq|XopQ]]      |                                                 | HopQ1 (HolPtoQ), RipB                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011349176.1|WP_011349176.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR001910/|Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase]]                                                                                                                                                                            | 
-|XopS |[[:bacteria:t3e:xops|XopS]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_039418869.1|WP_039418869.1]] |  | +| XopR    | [[:bacteria:t3e:xopr|XopR]]      |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011260681.1|WP_011260681.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopT |[[:bacteria:t3e:xopt|XopT]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_199285673.1|WP_199285673.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR035915/|Plectin-repeat]] | +| XopS    | [[:bacteria:t3e:xops|XopS]]      |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_039418869.1|WP_039418869.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopU |[[:bacteria:t3e:xopu|XopU]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011408937.1|WP_011408937.1]] |  | +| XopT    | [[:bacteria:t3e:xopt|XopT]]      |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_199285673.1|WP_199285673.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR035915/|Plectin-repeat]]                                                                                                                                                                                                             | 
-|XopV |[[:bacteria:t3e:xopv|XopV]] |  |RipAD |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011409498.1|WP_011409498.1]] |  | +| XopU    | [[:bacteria:t3e:xopu|XopU]]      |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011408937.1|WP_011408937.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopW |[[:bacteria:t3e:xopw|XopW]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_228329674.1|WP_228329674.1]] |  | +| XopV    | [[:bacteria:t3e:xopv|XopV]]      |                                                 | RipAD                                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011409498.1|WP_011409498.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopX |[[:bacteria:t3e:xopx|XopX]] |  |HopAE1 (HolPsyAE), RipBI |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011346212.1|WP_011346212.1]] |  | +| XopW    | [[:bacteria:t3e:xopw|XopW]]      |                                                 | RS_T3E_Hyp14                                          | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_228329674.1|WP_228329674.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopY |[[:bacteria:t3e:xopy|XopY]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011408080.1|WP_011408080.1]] |  | +| XopX    | [[:bacteria:t3e:xopx|XopX]]      |                                                 | HopAE1 (HolPsyAE), RipBI                              | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011346212.1|WP_011346212.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopZ |[[:bacteria:t3e:xopz|XopZ1]] |  |HopAS1 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011259177.1|WP_011259177.1]] |  | +| XopY    | [[:bacteria:t3e:xopy|XopY]]      |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011408080.1|WP_011408080.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopZ |[[:bacteria:t3e:xopz|XopZ2]] |  |HopAS1 |[[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_039421390.1|WP_039421390.1]] |  | +| XopZ    | [[:bacteria:t3e:xopz|XopZ1]]     |                                                 | HopAS1                                                | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011259177.1|WP_011259177.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAA |[[:bacteria:t3e:xopaa|XopAA]] |Ecf |HopAE1 (HolPsyAE), weakly related to RipBI |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_041855088.1|WP_041855088.1]] |Early chlorosis factor; Proteasome/cyclosome repeat | +| XopZ    | [[:bacteria:t3e:xopz|XopZ2]]     |                                                 | HopAS1                                                | [[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_039421390.1|WP_039421390.1]]   |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAB |[[:bacteria:t3e:xopab|XopAB]] |  |weakly related to XopN |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011409110.1|WP_011409110.1]] |  | +| XopAA   | [[:bacteria:t3e:xopaa|XopAA]]    | Ecf                                             | HopAE1 (HolPsyAE), weakly related to RipBI            | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_041855088.1|WP_041855088.1]]  | Early chlorosis factor; Proteasome/cyclosome repeat                                                                                                                                                                                                                                     | 
-|XopAC |[[:bacteria:t3e:xopac|XopAC]] |AvrAC |RipAC (formerly PopC) |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011269629.1|WP_011269629.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR003591/|LRR motif]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR032675/|LRR domain]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR003812/|Fido domain]]; Vascular hypersensitivity in //Arabidopsis// landrace Col-0  | +| XopAB   | [[:bacteria:t3e:xopab|XopAB]]    |                                                 | weakly related to XopN                                | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011409110.1|WP_011409110.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAD |[[:bacteria:t3e:xopad|XopAD]] |  |RipS3 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011409710.1|WP_011409710.1]] |SKWP repeat protein; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR011989/|Armadillo-like helical repeat]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR016024/|Armadillo-type fold]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR007685/|RelA/SpoT superfamily]] | +| XopAC   | [[:bacteria:t3e:xopac|XopAC]]    | AvrAC                                           | RipAC (formerly PopC)                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011269629.1|WP_011269629.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR003591/|LRR motif]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR032675/|LRR domain]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR003812/|Fido domain]]; Vascular hypersensitivity in //Arabidopsis// landrace Col-0  | 
-|XopAE |[[:bacteria:t3e:xopae|XopAE]] |HpaF/HpaG |RipAC (formerly PopC) |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011050288.1|WP_011050288.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR003591/|LRR motif]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR032675/|LRR domain]] | +| XopAD   | [[:bacteria:t3e:xopad|XopAD]]    |                                                 | RipS3                                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011409710.1|WP_011409710.1]]  | SKWP repeat protein; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR011989/|Armadillo-like helical repeat]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR016024/|Armadillo-type fold]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR007685/|RelA/SpoT superfamily]]   | 
-|XopAF |[[:bacteria:t3e:xopaf|XopAF1]] |AvrXv3 |HopAF1 (HopPtoJ), RipBD |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_008577605.1|WP_008577605.1]] |  | +| XopAE   | [[:bacteria:t3e:xopae|XopAE]]    | HpaF/HpaG                                       | RipAC (formerly PopC)                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011050288.1|WP_011050288.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR003591/|LRR motif]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR032675/|LRR domain]]                                                                                                                                         | 
-|XopAF |[[:bacteria:t3e:xopaf|XopAF2]] |  |HopAF1 (HopPtoJ), RipBD |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_227479740.1|WP_227479740.1]] |  | +| XopAF   | [[:bacteria:t3e:xopaf|XopAF1]]   | AvrXv3                                          | HopAF1 (HopPtoJ), RipBD                               | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_008577605.1|WP_008577605.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAG |[[:bacteria:t3e:xopag|XopAG1]] |AvrGf1 |HopG1 (HopPtoG), HolPtoW, RipO1 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_272820829.1|WP_272820829.1]] |  | +| XopAF   | [[:bacteria:t3e:xopaf|XopAF2]]   |                                                 | HopAF1 (HopPtoJ), RipBD                               | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_227479740.1|WP_227479740.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAG |[[:bacteria:t3e:xopag|XopAG2]] |AvrGf2 |HopG1 (HopPtoG), HolPtoW, RipO1 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_007970248.1|WP_007970248.1]] |  | +| XopAG   | [[:bacteria:t3e:xopag|XopAG1]]   | AvrGf1                                          | HopG1 (HopPtoG), HolPtoW, RipO1                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_272820829.1|WP_272820829.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAH |[[:bacteria:t3e:xopah|XopAH]] |AvrXccC |AvrB/AvrC (AvrPphC) |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011037263.1|WP_011037263.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR008798/|AvrB/AvrC-family avirulence protein]] | +| XopAG   | [[:bacteria:t3e:xopag|XopAG2]]   | AvrGf2                                          | HopG1 (HopPtoG), HolPtoW, RipO1                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_007970248.1|WP_007970248.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAI |[[:bacteria:t3e:xopai|XopAI]] |  |HopO1 (HopPtoO, HopPtoS), HopAI1 (HolPtoAI) |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011052119.1|WP_011052119.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR000768/|NAD:arginine ADP-ribosyltransferase]] | +| XopAH   | [[:bacteria:t3e:xopah|XopAH]]    | AvrXccC                                         | AvrB/AvrC (AvrPphC)                                   | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011037263.1|WP_011037263.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR008798/|AvrB/AvrC-family avirulence protein]]                                                                                                                                                                                        | 
-|XopAJ |[[:bacteria:t3e:xopaj|XopAJ]] |AvrRxo1 |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_014504815.1|WP_014504815.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR027417/|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase]] | +| XopAI   | [[:bacteria:t3e:xopai|XopAI]]    |                                                 | HopO1 (HopPtoO, HopPtoS), HopAI1 (HolPtoAI)           | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011052119.1|WP_011052119.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR000768/|NAD:arginine ADP-ribosyltransferase]]                                                                                                                                                                                        | 
-|XopAK |[[:bacteria:t3e:xopak|XopAK]] |  |HopK1 (HopPtoK, HolPtoAB) C-terminal domain, RipBQ |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_269466020.1|WP_269466020.1]] |  | +| XopAJ   | [[:bacteria:t3e:xopaj|XopAJ]]    | AvrRxo1                                         |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_014504815.1|WP_014504815.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR027417/|P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase]]                                                                                                                                                                        | 
-|XopAL |[[:bacteria:t3e:xopal1|XopAL1]] |  |Eop3, weakly similar to HopX, RipE2 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_274360846.1|WP_274360846.1]] |  | +| XopAK   | [[:bacteria:t3e:xopak|XopAK]]    |                                                 | HopK1 (HopPtoK, HolPtoAB) C-terminal domain, RipBQ    | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_269466020.1|WP_269466020.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAL |[[:bacteria:t3e:xopal2|XopAL2]] |  |Eop3, RS_T3E_Hyp14 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_012437264.1|WP_012437264.1]] |  | +| XopAL   | [[:bacteria:t3e:xopal1|XopAL1]]  |                                                 | Eop3, weakly similar to HopX, RipE2                   | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_274360846.1|WP_274360846.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAM |[[:bacteria:t3e:xopam|XopAM]] |  |HopR1, RipR |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_012438997.1|WP_012438997.1]] |AvrE-family effector | +| XopAL   | [[:bacteria:t3e:xopal2|XopAL2]]  |                                                 | Eop3, RS_T3E_Hyp14                                    | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_012437264.1|WP_012437264.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAN |[[:bacteria:t3e:xopan|XopAN]] |  |  |  |  | +| XopAM   | [[:bacteria:t3e:xopam|XopAM]]    |                                                 | HopR1, RipR                                           | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_012438997.1|WP_012438997.1]]  | AvrE-family effector                                                                                                                                                                                                                                                                    | 
-|XopAO |[[:bacteria:t3e:xopao|XopAO]] |  |AvrRpm1, RipBA |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_162267513.1|WP_162267513.1]] |  | +| XopAN   | [[:bacteria:t3e:xopan|XopAN]]    |                                                 |                                                       |                                                                         | Replaced by XopAV                                                                                                                                                                                                                                                                       | 
-|XopAP |[[:bacteria:t3e:xopap|XopAP]] |  |RipAL |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_236504155.1|WP_236504155.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR029058/|α/β hydrolase fold]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF01764/|Class-3 lipase]] | +| XopAO   | [[:bacteria:t3e:xopao|XopAO]]    |                                                 | AvrRpm1, RipBA                                        | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_162267513.1|WP_162267513.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAQ |[[:bacteria:t3e:xopaq|XopAQ]] |  |RipAH/RipAG |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_233366621.1|WP_233366621.1]] |  | +| XopAP   | [[:bacteria:t3e:xopap|XopAP]]    |                                                 | RipAL                                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_236504155.1|WP_236504155.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR029058/|α/β hydrolase fold]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF01764/|Class-3 lipase]]                                                                                                                                  | 
-|XopAR |[[:bacteria:t3e:xopar|XopAR]] |  |RipBE |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/APO95022.1|(APO95022.1)]] |  | +| XopAQ   | [[:bacteria:t3e:xopaq|XopAQ]]    |                                                 | RipAH/RipAG                                           | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_233366621.1|WP_233366621.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAS |[[:bacteria:t3e:xopas|XopAS]] |  |HopAS1 |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_229015407.1|WP_229015407.1]] |  | +| XopAR   | [[:bacteria:t3e:xopar|XopAR]]    |                                                 | RipBE                                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/APO95022.1|(APO95022.1)]]        |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAT |[[:bacteria:t3e:xopat|XopAT]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/AEL06363.1|(AEL06363.1)]] |  | +| XopAS   | [[:bacteria:t3e:xopas|XopAS]]    |                                                 | HopAS1                                                | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_229015407.1|WP_229015407.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAU |[[:bacteria:t3e:xopau|XopAU]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_041855031.1|WP_041855031.1]] |Serine/threonine kinase; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR000719/|Protein kinase domain]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR017441/|ATP-binding site]] | +| XopAT   | [[:bacteria:t3e:xopat|XopAT]]    |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/AEL06363.1|(AEL06363.1)]]        |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAV |[[:bacteria:t3e:xopav|XopAV1]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_065628638.1|WP_065628638.1]] |  | +| XopAU   | [[:bacteria:t3e:xopau|XopAU]]    |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_041855031.1|WP_041855031.1]]  | Serine/threonine kinase; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR000719/|Protein kinase domain]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR017441/|ATP-binding site]]                                                                                              | 
-|XopAV |[[:bacteria:t3e:xopav|XopAV2]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011269951.1|WP_011269951.1]] |  | +| XopAV   | [[:bacteria:t3e:xopav|XopAV1]]   |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_065628638.1|WP_065628638.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAW |[[:bacteria:t3e:xopaw|XopAW]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011348129.1|WP_011348129.1]] |Calcium-binding protein; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR002048/|EF-hand domain]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR018247/|Calcium-binding site]] | +| XopAV   | [[:bacteria:t3e:xopav|XopAV2]]   |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011269951.1|WP_011269951.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAX |[[:bacteria:t3e:xopax|XopAX]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_041854960.1|WP_041854960.1]] |  | +| XopAW   | [[:bacteria:t3e:xopaw|XopAW]]    |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011348129.1|WP_011348129.1]]  | Calcium-binding protein; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR002048/|EF-hand domain]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR018247/|Calcium-binding site]]                                                                                                 | 
-|XopAY |[[:bacteria:t3e:xopay|XopAY]] |  |  |  |  | +| XopAX   | [[:bacteria:t3e:xopax|XopAX]]    |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_041854960.1|WP_041854960.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopAZ |[[:bacteria:t3e:xopaz|XopAZ]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_104549896.1|WP_104549896.1]] |SlpA superfamily; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR001179/|FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase]] | +| XopAY   | [[:bacteria:t3e:xopay|XopAY]]    |                                                 |                                                       |                                                                         | Replaced by XopAV                                                                                                                                                                                                                                                                       | 
-|XopBA |[[:bacteria:t3e:xopba|XopBA]] |  |HopW1, RipBP |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_227478587.1|WP_227478587.1]] |  | +| XopAZ   | [[:bacteria:t3e:xopaz|XopAZ]]    |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_104549896.1|WP_104549896.1]]  | SlpA superfamily; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR001179/|FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase]]                                                                                                                                                            | 
-|XopBB |[[:bacteria:t3e:xopbb|XopBB]] |  |HopF2 (AvrPphF) |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_251761698.1|WP_251761698.1]] |  | +| XopBA   | [[:bacteria:t3e:xopba|XopBA]]    |                                                 | HopW1, RipBP                                          | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_227478587.1|WP_227478587.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopBC |  |  |  |  |= XopAV class | +| XopBB   | [[:bacteria:t3e:xopbb|XopBB]]    |                                                 | HopF2 (AvrPphF)                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_251761698.1|WP_251761698.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-|XopBD |  |  |  |  |= XopAT class | +| XopBC   |                                  |                                                 |                                                       |                                                                         | = XopAV class                                                                                                                                                                                                                                                                           | 
-|XopBE |  |  |  |  |= XopC class | +| XopBD   |                                  |                                                 |                                                       |                                                                         | = XopAT class                                                                                                                                                                                                                                                                           | 
-|XopBF |  |  |  |  |= XopAV class | +| XopBE   |                                  |                                                 |                                                       |                                                                         | = XopC class                                                                                                                                                                                                                                                                            | 
-|XopBG |[[:bacteria:t3e:xopbg|XopBG]] |  |  |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_145953988.1|WP_145953988.1]] |  |+| XopBF   |                                  |                                                 |                                                       |                                                                         | = XopAV class                                                                                                                                                                                                                                                                           | 
 +| XopBG   | [[:bacteria:t3e:xopbg|XopBG]]    |                                                 |                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_145953988.1|WP_145953988.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
 +| XopBH   |                                  |                                                 |                                                       |                                                                         | Reserved. Please contact Ralf Koebnik.                                                                                                                                                                                                                                                  | 
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-===== Avirulence or type 3-secreted proteins that are not considered effectors in a narrow sense =====+===== Avirulence or type III-secreted proteins that are not considered effectors in a narrow sense =====
  
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Line 115: Line 119:
 |HrpW |  |RipW (formerly PopW) |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_005926112.1|WP_005926112.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF03211|Pectate lyase]], perhaps not a T3E |Charkowski //et al.//, 1998; Li //et al.//, 2010  | |HrpW |  |RipW (formerly PopW) |[[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_005926112.1|WP_005926112.1]] |[[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF03211|Pectate lyase]], perhaps not a T3E |Charkowski //et al.//, 1998; Li //et al.//, 2010  |
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 ===== References ===== ===== References =====
bacteria/t3e/t3e.1710588681.txt.gz · Last modified: 2024/03/16 11:31 by rkoebnik

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