EuroXanth DokuWiki

User Tools

Site Tools

Trace:
bacteria:t3e:t3e

Differences

This shows you the differences between two versions of the page.

Link to this comparison view

Both sides previous revisionPrevious revision
bacteria:t3e:t3e [2026/03/18 14:28] – [References] rkoebnikbacteria:t3e:t3e [2026/03/18 14:42] (current) – [Table] rkoebnik
Line 50: Line 50:
 | XopJ    | [[:bacteria:t3e:xopj5|XopJ5]]    | 10                          | AvrXccB                                         | HopZ1, RipK, RipP1 (formerly PopP1)                         | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_228442257.1|WP_228442257.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]]                                                                                                                                                                                                  | | XopJ    | [[:bacteria:t3e:xopj5|XopJ5]]    | 10                          | AvrXccB                                         | HopZ1, RipK, RipP1 (formerly PopP1)                         | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_228442257.1|WP_228442257.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]]                                                                                                                                                                                                  |
 | XopJ    | [[:bacteria:t3e:xopj6|XopJ6]]    | 10                          |                                                 | RipP2 (formerly PopP2)                                      | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_196765268.1|WP_196765268.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]]                                                                                                                                                                                                  | | XopJ    | [[:bacteria:t3e:xopj6|XopJ6]]    | 10                          |                                                 | RipP2 (formerly PopP2)                                      | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_196765268.1|WP_196765268.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]]                                                                                                                                                                                                  |
-| XopJ    | [[:bacteria:t3e:xopj7|XopJ7]]    |                             |                                                 | HopZ1, RipP3 (formerly PopP3)                               | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/QDI05802.1|(QDI05802.1)]]        | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]]                                                                                                                                                                                                  | +| XopJ    | [[:bacteria:t3e:xopj7|XopJ7]]    | 10                          |                                                 | HopZ1, RipP3 (formerly PopP3)                               | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/QDI05802.1|(QDI05802.1)]]        | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]]                                                                                                                                                                                                  | 
-| XopJ    | [[:bacteria:t3e:xopj8|XopJ8]]    |                             |                                                 | HopZ1, RipP1 (formerly PopP1)                               | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_104559054.1|WP_104559054.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]]                                                                                                                                                                                                  |+| XopJ    | [[:bacteria:t3e:xopj8|XopJ8]]    | 10                          |                                                 | HopZ1, RipP1 (formerly PopP1)                               | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_104559054.1|WP_104559054.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR005083/|Ser/Thr acetyltransferase]]                                                                                                                                                                                                  |
 | XopK    | [[:bacteria:t3e:xopk|XopK]]      | 24                          |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_027703763.1|WP_027703763.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | | XopK    | [[:bacteria:t3e:xopk|XopK]]      | 24                          |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_027703763.1|WP_027703763.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
 | XopL    | [[:bacteria:t3e:xopl|XopL]]      | 5                           |                                                 | RipAC (formerly PopC)                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_218498620.1|WP_218498620.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR003591/|LRR motif]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR001611/|LRR domain]]                                                                                                                                         | | XopL    | [[:bacteria:t3e:xopl|XopL]]      | 5                           |                                                 | RipAC (formerly PopC)                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_218498620.1|WP_218498620.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR003591/|LRR motif]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR001611/|LRR domain]]                                                                                                                                         |
Line 65: Line 65:
 | XopV    | [[:bacteria:t3e:xopv|XopV]]      | 15                          |                                                 | RipAD                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011409498.1|WP_011409498.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | | XopV    | [[:bacteria:t3e:xopv|XopV]]      | 15                          |                                                 | RipAD                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011409498.1|WP_011409498.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
 | XopW    | [[:bacteria:t3e:xopw|XopW1]]     | 65                          |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_228329674.1|WP_228329674.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | | XopW    | [[:bacteria:t3e:xopw|XopW1]]     | 65                          |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_228329674.1|WP_228329674.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
-| XopW    | [[:bacteria:t3e:xopw|XopW2]]     |                             |                                                 | RS_T3E_Hyp7                                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_211288317.1|WP_211288317.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | +| XopW    | [[:bacteria:t3e:xopw|XopW2]]     | 65                          |                                                 | RS_T3E_Hyp7                                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_211288317.1|WP_211288317.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-| XopW    | [[:bacteria:t3e:xopw|XopW3]]     |                             |                                                 | RS_T3E_Hyp7                                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_205393482.1|WP_205393482.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | +| XopW    | [[:bacteria:t3e:xopw|XopW3]]     | 65                          |                                                 | RS_T3E_Hyp7                                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_205393482.1|WP_205393482.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-| XopW    | [[:bacteria:t3e:xopw|XopW4]]     |                             |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_233380913.1|WP_233380913.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | +| XopW    | [[:bacteria:t3e:xopw|XopW4]]     | 65                          |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_233380913.1|WP_233380913.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-| XopW    | [[:bacteria:t3e:xopw|XopW5]]     |                             |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_230597584.1|WP_230597584.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |+| XopW    | [[:bacteria:t3e:xopw|XopW5]]     | 65                          |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_230597584.1|WP_230597584.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
 | XopX    | [[:bacteria:t3e:xopx|XopX]]      | 9                           |                                                 | HopAE1 (HolPsyAE), RipBI                                    | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011346212.1|WP_011346212.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | | XopX    | [[:bacteria:t3e:xopx|XopX]]      | 9                           |                                                 | HopAE1 (HolPsyAE), RipBI                                    | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011346212.1|WP_011346212.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
 | XopY    | [[:bacteria:t3e:xopy|XopY]]      | 60                          |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011408080.1|WP_011408080.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | | XopY    | [[:bacteria:t3e:xopy|XopY]]      | 60                          |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011408080.1|WP_011408080.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
Line 74: Line 74:
 | XopZ    | [[:bacteria:t3e:xopz|XopZ2]]     | 18                          |                                                 | HopAS1                                                      | [[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_039421390.1|WP_039421390.1]]   |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | | XopZ    | [[:bacteria:t3e:xopz|XopZ2]]     | 18                          |                                                 | HopAS1                                                      | [[http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_039421390.1|WP_039421390.1]]   |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
 | XopAA   | [[:bacteria:t3e:xopaa|XopAA]]    | 9                           | Ecf                                             | HopAE1 (HolPsyAE), weakly related to RipBI                  | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_041855088.1|WP_041855088.1]]  | Early chlorosis factor; Proteasome/cyclosome repeat                                                                                                                                                                                                                                     | | XopAA   | [[:bacteria:t3e:xopaa|XopAA]]    | 9                           | Ecf                                             | HopAE1 (HolPsyAE), weakly related to RipBI                  | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_041855088.1|WP_041855088.1]]  | Early chlorosis factor; Proteasome/cyclosome repeat                                                                                                                                                                                                                                     |
-| XopAB   | [[:bacteria:t3e:xopab|XopAB]]    | NA                          |                                                 | weakly related to XopN                                      | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011409110.1|WP_011409110.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |+| XopAB   | [[:bacteria:t3e:xopab|XopAB]]    | unclassified                |                                                 | weakly related to XopN                                      | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011409110.1|WP_011409110.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
 | XopAC   | [[:bacteria:t3e:xopac|XopAC]]    | 115                         | AvrAC                                           | RipAC (formerly PopC)                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011269629.1|WP_011269629.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR003591/|LRR motif]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR032675/|LRR domain]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR003812/|Fido domain]]; Vascular hypersensitivity in //Arabidopsis// landrace Col-0  | | XopAC   | [[:bacteria:t3e:xopac|XopAC]]    | 115                         | AvrAC                                           | RipAC (formerly PopC)                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011269629.1|WP_011269629.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR003591/|LRR motif]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR032675/|LRR domain]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR003812/|Fido domain]]; Vascular hypersensitivity in //Arabidopsis// landrace Col-0  |
 | XopAD   | [[:bacteria:t3e:xopad|XopAD]]    | 2                           |                                                 | RipS3                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011409710.1|WP_011409710.1]]  | SKWP repeat protein; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR011989/|Armadillo-like helical repeat]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR016024/|Armadillo-type fold]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR007685/|RelA/SpoT superfamily]]   | | XopAD   | [[:bacteria:t3e:xopad|XopAD]]    | 2                           |                                                 | RipS3                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011409710.1|WP_011409710.1]]  | SKWP repeat protein; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR011989/|Armadillo-like helical repeat]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR016024/|Armadillo-type fold]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR007685/|RelA/SpoT superfamily]]   |
Line 89: Line 89:
 | XopAL   | [[:bacteria:t3e:xopal2|XopAL2]]  | 34                          |                                                 | RS_T3E_Hyp14, Eop3, RipE2, weakly similar to HopX           | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_012437264.1|WP_012437264.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | | XopAL   | [[:bacteria:t3e:xopal2|XopAL2]]  | 34                          |                                                 | RS_T3E_Hyp14, Eop3, RipE2, weakly similar to HopX           | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_012437264.1|WP_012437264.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
 | XopAM   | [[:bacteria:t3e:xopam|XopAM]]    | 11                          |                                                 | HopR1, RipR                                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_012438997.1|WP_012438997.1]]  | AvrE-family effector                                                                                                                                                                                                                                                                    | | XopAM   | [[:bacteria:t3e:xopam|XopAM]]    | 11                          |                                                 | HopR1, RipR                                                 | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_012438997.1|WP_012438997.1]]  | AvrE-family effector                                                                                                                                                                                                                                                                    |
-| XopAN   | [[:bacteria:t3e:xopan|XopAN]]    |                             |                                                 |                                                             |                                                                         | Replaced by XopAV                                                                                                                                                                                                                                                                       |+| XopAN   | [[:bacteria:t3e:xopan|XopAN]]    | 14                          |                                                 |                                                             |                                                                         | Replaced by XopAV                                                                                                                                                                                                                                                                       |
 | XopAO   | [[:bacteria:t3e:xopao|XopAO]]    | 4                           |                                                 | AvrRpm1, RipBA                                              | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_162267513.1|WP_162267513.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | | XopAO   | [[:bacteria:t3e:xopao|XopAO]]    | 4                           |                                                 | AvrRpm1, RipBA                                              | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_162267513.1|WP_162267513.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
 | XopAP   | [[:bacteria:t3e:xopap|XopAP]]    | 26                          |                                                 | RipAL                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_236504155.1|WP_236504155.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR029058/|α/β hydrolase fold]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF01764/|Class-3 lipase]]                                                                                                                                  | | XopAP   | [[:bacteria:t3e:xopap|XopAP]]    | 26                          |                                                 | RipAL                                                       | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_236504155.1|WP_236504155.1]]  | [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR029058/|α/β hydrolase fold]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/pfam/PF01764/|Class-3 lipase]]                                                                                                                                  |
Line 101: Line 101:
 | XopAW   | [[:bacteria:t3e:xopaw|XopAW]]    | 36                          |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011348129.1|WP_011348129.1]]  | Calcium-binding protein; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR002048/|EF-hand domain]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR018247/|Calcium-binding site]]                                                                                                 | | XopAW   | [[:bacteria:t3e:xopaw|XopAW]]    | 36                          |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_011348129.1|WP_011348129.1]]  | Calcium-binding protein; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR002048/|EF-hand domain]]; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR018247/|Calcium-binding site]]                                                                                                 |
 | XopAX   | [[:bacteria:t3e:xopax|XopAX]]    | 125                         |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_041854960.1|WP_041854960.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | | XopAX   | [[:bacteria:t3e:xopax|XopAX]]    | 125                         |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_041854960.1|WP_041854960.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
-| XopAY   | [[:bacteria:t3e:xopay|XopAY]]    |                             |                                                 |                                                             |                                                                         | Replaced by XopAV                                                                                                                                                                                                                                                                       |+| XopAY   | [[:bacteria:t3e:xopay|XopAY]]    | 14                          |                                                 |                                                             |                                                                         | Replaced by XopAV                                                                                                                                                                                                                                                                       |
 | XopAZ   | [[:bacteria:t3e:xopaz|XopAZ]]    | 1                           |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_104549896.1|WP_104549896.1]]  | SlpA superfamily; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR001179/|FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase]]                                                                                                                                                            | | XopAZ   | [[:bacteria:t3e:xopaz|XopAZ]]    | 1                           |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_104549896.1|WP_104549896.1]]  | SlpA superfamily; [[https://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/InterPro/IPR001179/|FKBP-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase]]                                                                                                                                                            |
-| XopBA   | [[:bacteria:t3e:xopba|XopBA]]    |                             |                                                 | HopW1, RipBP                                                | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_227478587.1|WP_227478587.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |+| XopBA   | [[:bacteria:t3e:xopba|XopBA]]    | 99                          |                                                 | HopW1, RipBP                                                | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_227478587.1|WP_227478587.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
 | XopBB   | [[:bacteria:t3e:xopbb|XopBB]]    | 44                          |                                                 | HopF2 (AvrPphF)                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_251761698.1|WP_251761698.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | | XopBB   | [[:bacteria:t3e:xopbb|XopBB]]    | 44                          |                                                 | HopF2 (AvrPphF)                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_251761698.1|WP_251761698.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
-| XopBC   |                                  |                             |                                                 |                                                             |                                                                         | = XopAV class                                                                                                                                                                                                                                                                           | +| XopBC   |                                  | 14                          |                                                 |                                                             |                                                                         | = XopAV class                                                                                                                                                                                                                                                                           | 
-| XopBD   |                                  |                             |                                                 |                                                             |                                                                         | = XopAT class                                                                                                                                                                                                                                                                           | +| XopBD   |                                  | 124                         |                                                 |                                                             |                                                                         | = XopAT class                                                                                                                                                                                                                                                                           | 
-| XopBE   |                                  |                             |                                                 |                                                             |                                                                         | = XopC class                                                                                                                                                                                                                                                                            | +| XopBE   |                                  | 19                          |                                                 |                                                             |                                                                         | = XopC class                                                                                                                                                                                                                                                                            | 
-| XopBF   |                                  |                             |                                                 |                                                             |                                                                         | = XopAV class                                                                                                                                                                                                                                                                           | +| XopBF   |                                  | 14                          |                                                 |                                                             |                                                                         | = XopAV class                                                                                                                                                                                                                                                                           | 
-| XopBG   | [[:bacteria:t3e:xopbg|XopBG]]    |                             |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_145953988.1|WP_145953988.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | +| XopBG   | [[:bacteria:t3e:xopbg|XopBG]]    | unclassified                |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_145953988.1|WP_145953988.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         | 
-| XopBH   | [[:bacteria:t3e:xopbh|XopBH]]    |                             |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_212580660.1|WP_212580660.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |+| XopBH   | [[:bacteria:t3e:xopbh|XopBH]]    | unclassified                |                                                 |                                                             | [[https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/WP_212580660.1|WP_212580660.1]]  |                                                                                                                                                                                                                                                                                         |
  
 </datatables> </datatables>
bacteria/t3e/t3e.txt · Last modified: 2026/03/18 14:42 by rkoebnik

Page Tools

Except where otherwise noted, content on this wiki is licensed under the following license: CC Attribution-Share Alike 4.0 International
CC Attribution-Share Alike 4.0 International Donate Powered by PHP Valid HTML5 Valid CSS Driven by DokuWiki